[发明专利]成纤维细胞生长因子受体2（FGFR2）蛋白质的SRM/MRM测定

权利要求书

1.一种测量生物样品中成纤维细胞生长因子受体2蛋白质(FGFR2)水平的方法，包括使用质谱检测和/或定量来自所述生物样品的蛋白质消化物中一种或多种修饰的或未修饰的FGFR2片段肽的含量；和计算所述样品中修饰的或未修饰的FGFR2蛋白质的水平；且

其中所述水平是相对水平或绝对水平。

2.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括在检测和/或定量一种或多种修饰的或未修饰的FGFR2片段肽之前对所述蛋白质消化物进行分级的步骤。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述的分级的步骤选自由凝胶电泳、液相色谱、毛细管电泳、纳米反相液相色谱、高效液相色谱或反相高效液相色谱组成的组。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述生物样品的所述蛋白质消化物通过Liquid Tissue方案制备。

5.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述蛋白质消化物包含蛋白酶消化物。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述蛋白质消化物包含胰蛋白酶消化物。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述质谱包括串联质谱、离子阱质谱、三重四极质谱、MALDI-TOF质谱、MALDI质谱和/或飞行时间质谱。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所使用的质谱的模式是为选择反应监测(SRM)、多重反应监测(MRM)和/或多重选择反应监测(mSRM)。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述FGFR2片段肽包括如SEQ ID NO：1和SEQ ID N0：2所示的氨基酸序列。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述生物样品是血液样品、尿样品、血清样品、腹水样品、疲液样品、淋巴液、唾液样品、细胞或实体组织。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述组织是福尔马林固定的组织。

12.根据权利要求10或11所述的方法，其中所述组织是石蜡包埋的组织。

13.根据权利要求10所述的方法，其中所述组织从肿瘤获得。

14.根据权利要求13所述的方法，其中所述肿瘤是原发性肿瘤。

15.根据权利要求13所述的方法，其中所述肿瘤是继发性肿瘤。

16.根据权利要求1-15中任一项所述的方法，进一步包括定量修饰的或未修饰的FGFR2片段肽。

17.根据权利要求16所述的方法，其中定量所述FGFR2片段肽包括比较一种生物样品中如SEQ ID NO：1和SEQ ID N0：2所示的包含FGFR2的约8至约45个氨基酸残基的氨基酸序列的一种或多种FGFR2片段肽的含量与不同且单独的生物样品中相同FGFR2片段肽的含量。

18.根据权利要求17所述的方法，其中定量一种或多种FGFR2片段肽包括通过与已知含量的添加的内标肽相比较来确定生物样品中各FGFR2片段肽的含量，其中所述生物样品中各FGFR2片段肽的含量与具有相同氨基酸序列的内标肽相比较。

19.根据权利要求18所述的方法，其中所述内标肽是同位素标记的肽。

20.根据权利要求19所述的方法，其中同位素标记的内标肽包含一种或多种选自¹⁸O、¹⁷O、³⁴S、¹⁵N、¹³C、²H或其组合的重稳定同位素。

21.根据权利要求1-20中任一项所述的方法，其中检测和/或定量所述蛋白质消化物中一种或多种修饰的或未修饰的FGFR2片段肽的含量表示存在修饰的或未修饰的FGFR2蛋白质且与癌症相关联。

22.根据权利要求21所述的方法，其进一步包括关联所述检测和/或定量一种或多种修饰的或未修饰的FGFR2片段肽的含量或所述FGFR2蛋白质的水平的结果与所述癌症的诊断阶段/等级/状况。