[发明专利]肿瘤的判定方法

权利要求书

1.一种肿瘤的判定方法，包括以下工序：

(1)将由受检组织或细胞制备的基因组DNA用亚硫酸氢盐处理的工序，

其中，该受检组织或细胞是来自以下罹患肿瘤且判定为下述(i)(ii)情况的患者的组织或细胞，

(i)该肿瘤在MSI检查中被判定为MSI-H、和/或该肿瘤在免疫组织化学检查中被判定为MLH1的表达消失或降低，且，

(ii)通过遗传学检查被判定为在MLH1没有发现变异；

(2)从工序(1)中得到的经亚硫酸氢盐处理过的DNA中，将包含MLH1启动子区域的一部分或全部的DNA通过PCR进行扩增的工序；

(3)将工序(2)中得到的PCR扩增产物供于离子交换色谱，获得检测信号的工序；

(4)判定工序(3)中得到的检测信号的峰是否为表示高甲基化DNA的峰的工序；

(5)在工序(4)中，该峰被判定为表示高甲基化DNA的峰的情况下，将该肿瘤判定为来自非林奇综合征的患者的肿瘤的工序。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述受检组织或细胞是包含肿瘤的组织或细胞。

3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述肿瘤是大肠、子宫内膜、胃、卵巢、小肠、胆道、胰脏、肾盂、输尿管、脑或者皮脂腺中的肿瘤。

4.根据权利要求1～3中任一项所述的方法，其中，在所述工序(2)中，代替包含所述MLH1启动子区域的一部分或全部的DNA而将包含MLH1的启动子区域和/或Intron1区域的一部分或全部的DNA通过PCR进行扩增。

5.根据权利要求1～4中任一项所述的方法，其中，所述离子交换色谱为阴离子交换色谱。

6.根据权利要求1～5中任一项所述的方法，其中，所述离子交换色谱中使用的色谱柱填充剂在表面具有强阳离子性基团和弱阳离子性基团这两者。

7.一种获得用于判定肿瘤的数据的方法，包括以下工序：

(1)将由受检组织或细胞制备的基因组DNA用亚硫酸氢盐处理的工序，

其中，该受检组织或细胞是来自以下罹患肿瘤且判定为下述(i)(ii)情况的患者的组织或细胞，

(i)该肿瘤在MSI检查中被判定为MSI-H、和/或该肿瘤在免疫组织化学检查中被判定为MLH1的表达消失或降低，且

(ii)通过遗传学检查被判定为在MLH1没有发现变异；

(2)从工序(1)中得到的经亚硫酸氢盐处理过的DNA中，将包含MLH1启动子区域的一部分或全部的DNA通过PCR进行扩增的工序；

(3)将工序(2)中得到的PCR扩增产物供于离子交换色谱，获得检测信号的工序；

(4)获取工序(3)中得到的检测信号的峰是否为表示高甲基化DNA的峰作为用于判定该肿瘤是否为来自非林奇综合征的患者的肿瘤的数据的工序。

8.根据权利要求7所述的方法，其中，所述受检组织或细胞是包含肿瘤的组织或细胞。

9.根据权利要求8所述的方法，其中，所述肿瘤是大肠、子宫内膜、胃、卵巢、小肠、胆道、胰脏、肾盂、输尿管、脑或者皮脂腺中的肿瘤。

10.根据权利要求7～9中任一项所述的方法，其中，在所述工序(2)中，代替包含所述MLH1启动子区域的一部分或全部的DNA而将包含MLH1的启动子区域和/或Intron1区域的一部分或全部的DNA通过PCR进行扩增。

11.根据权利要求7～10中任一项所述的方法，其中，所述离子交换色谱为阴离子交换色谱。

12.根据权利要求7～11中任一项所述的方法，其中，所述离子交换色谱中使用的色谱柱填充剂在表面具有强阳离子性基团和弱阳离子性基团这两者。