[发明专利]用于HPV诱导的浸润性癌、非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症及其高级别前期病变的ZIC1和GHSR分子诊断标志物在审
申请号: | 201680059636.0 | 申请日: | 2016-08-25 |
公开(公告)号: | CN108368552A | 公开(公告)日: | 2018-08-03 |
发明(设计)人: | A·T·黑塞林克 | 申请(专利权)人: | 塞尔夫斯库林有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京德琦知识产权代理有限公司 11018 | 代理人: | 潘怀仁;王珍仙 |
地址: | 荷兰阿*** | 国省代码: | 荷兰;NL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 诱导 肛门生殖器 妇科癌症 浸润性癌 病变 超甲基化 癌症 高级别 检测 分子诊断 标志物 甲基化 试剂盒 基因 癌变 浸润 细胞 | ||
1.一种用于检测HPV诱导的高级别癌变前病变和HPV诱导的浸润性癌以及非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症的方法,所述方法包括检测细胞中GHSR和/或ZIC1基因的超甲基化,由此这样的超甲基化指示存在具有浸润潜力的HPV诱导的前期病变、HPV诱导的浸润性癌和非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述HPV诱导的高级别癌变前病变或HPV诱导的浸润性癌是高级别癌前宫颈病变或浸润性宫颈癌.
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述HPV诱导的浸润性癌是高风险HPV诱导的浸润性癌.
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述非HPV诱导的妇科癌症是子宫内膜癌。
5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述超甲基化在如图1和图2所示的富含CpG序列中检测。
6.一种根据权利要求1-5中任一项检测HPV诱导的高级别癌变前病变和HPV诱导的浸润性癌以及非HPV诱导的妇科癌症或肛门生殖器癌症的方法,其中所述超甲基化是与可比较的正常细胞相比,测试细胞中GHSR和/或ZIC1的富含CpG启动子和/或基因序列中增加的甲基化。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中试剂是选自由BssHII、MspI、NotI和HpaII组成的组中的甲基化敏感性限制性核酸内切酶。
8.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中所述方法涉及纳米技术,优选芯片上实验室技术。
9.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中进行甲基化特异性PCR,其基于DNA的亚硫酸氢盐修饰,然后进行靶向富含CpG序列的特异性PCR反应。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述试剂是与如图1或图2所示的核酸结合的核酸探针或引物。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述核酸探针或引物具有可检测的标记。
12.根据权利要求9、10或11所述的方法,其中所述核酸探针具有选自由以下组成的组中的核苷酸序列:
a)能够在严格条件下与图1所示的序列ZIC1或图2所示的序列GHSR杂交的多核苷酸序列;
b)与a)的多核苷酸中的一种具有至少70%同一性的多核苷酸;
c)与a)的多核苷酸中的一种互补的多核苷酸;以及
d)包括a)或b)的多核苷酸中的一种的至少15个碱基的多核苷酸。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法,其中确定所述GHSR和ZIC1基因的所述甲基化。
14.GHSR和/或ZIC1作为用于检测HPV诱导的高级别癌变前病变或HPV诱导的浸润性癌或非HPV诱导的妇科癌症或肛门生殖器癌症的分子诊断标志物的用途,优选地其中所述标志物的甲基化预测所述病变、癌或癌症的发生。
15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法,其中所述细胞来源于尿样本或宫颈样本。
16.根据权利要求15所述的方法,其中所述宫颈样本是自样本。
17.在检测HPV诱导的高级别癌变前病变或HPV诱导的浸润性癌或非HPV诱导的妇科癌症或肛门生殖器癌症的方法中使用的零件的试剂盒,所述试剂盒包括:
用于检测GHSR和/或ZIC1甲基化的装置,其中所述装置包括对于图1的ZIC1核苷酸序列和/或图2的GHSR核苷酸序列特异性的探针和/或引物;
用于检测HPV感染的装置,其中所述装置包括对于HPV特异性的探针和引物。
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