[发明专利]用于HPV诱导的浸润性癌、非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症及其高级别前期病变的ZIC1和GHSR分子诊断标志物

说明书

本发明涉及用于检测HPV诱导的高级别癌变前病变、HPV诱导的浸润性癌和非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症的方法，所述方法包括检测细胞中ZIC1和/或GHSR基因中的超甲基化，由此这样的超甲基化指示存在具有浸润潜力的HPV诱导的前期病变、HPV诱导的浸润性癌和非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症。本发明进一步包括ZIC1和/或GHSR基因在用于检测ZIC1和/或GHSR甲基化的这样的方法和试剂盒中的用途。

技术领域

本发明涉及癌症预防和医学诊断领域；并涉及用于癌症，尤其是人乳头瘤病毒(HPV)诱导的浸润性癌及其高级别前期病变，比如浸润性宫颈癌和癌变前宫颈病变、非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症的分子诊断标志物。尤其，本发明涉及ZIC1和GHSR基因组调控序列作为hrHPV诱导的浸润性癌、非HPV诱导的妇科癌症和肛门生殖器癌症及其具有浸润潜力的癌前病变的标志物的用途。

背景技术

宫颈癌是世界范围内女性第四大常见癌症，并且每年造成大约250,000例癌症死亡。

宫颈鳞状细胞癌的发展特征在于一系列癌变前病变，即所谓的宫颈上皮内瘤样病变(CIN)，其分级为1至3级，分别指轻度非典型增生(CIN1)、中度非典型增生(CIN2)和重度非典型增生/原位癌(CIN3)。CIN1也被称为低级别鳞状上皮内病变(LSIL)并且CIN2和CIN3一起被称为高级别鳞状上皮内病变(HSIL)。对于宫颈腺癌，原位腺癌(ACIS)是确定的前期病变。原则上，这些癌变前病变是可逆的，但是病变越严重，自发性消退的机会就越低。宫颈癌被认为是可预防的疾病，因为癌前阶段可以通过脱落细胞学检测，并且在必要时治疗相对容易，仅有轻微副作用。宫颈筛查的目的是早期诊断高级别癌前病变(即，CIN2/3和原位腺癌)和可治疗的癌性病变，从而降低浸润性宫颈癌的死亡率。一般的医疗实践包括治疗所有形态学证实的CIN2、CIN3和原位腺癌的女性，以便防止宫颈癌的发展。

在过去的十年中，已经确定了宫颈癌发生是由感染高风险人乳头瘤病毒(hrHPV)引发的。已经显示分别干扰p53和Rb肿瘤抑制剂途径的病毒癌基因E6和E7的表达对肿瘤发生和恶性表型的维持两者都是必需的。因此，对hrHPV进行测试看起来是有吸引力的初步筛查工具。然而，与癌发生的多阶段过程相一致，hrHPV感染的细胞向浸润性癌细胞发展要求宿主细胞基因组中额外的改变。只有一小部分感染高风险HPV的女性将发展为高级别癌前宫颈病变(CIN2/3)，并且如果不治疗，则发展为宫颈癌。在大多数患有宫颈癌变前病变的女性中，该病变自发性消退。在参与基于人群的筛查的女性中，约5％-6％测试为阳性hrHPV.然而，她们中最多只有20％(1％的参与女性)患有≥CIN2/3。因此，通过hrHPV测试的初级筛查将伴随大量冗余的后续程序和女性不必要的焦虑，除非可将标志物适用于允许将hrHPV阳性的女性分级为≥CIN2/3和≥原位腺癌风险的宫颈涂片。

主要的挑战是将HPV测试为阳性的女性的百分比降低到那些具有临床意义病变的患者。一种模式是使用细胞学作为用于hrHPV阳性女性的二级(所谓分类)测试。尽管如此，这仍使得大量细胞学正常的hrHPV阳性女性(筛查人群中3.5％的女性)中仍有10％的患有或获得≥CIN3.此外，细胞学对于可以在家中采取的自采样的宫颈阴道样本行不通，因为这些样本不代表宫颈的细胞学状态。另一种模式是使用HPV16/18基因分型.然而，这使得非HPV16/18型的女性尽管程度较轻但也存在≥CIN2/3和≥原位腺癌的风险。因此，需要补充或可替换的分类工具，以将hrHPV阳性女性分级为患有或未患有≥CIN2/3和≥原位腺癌的hrHPV阳性女性。