[发明专利]用于检测肝脏纤维化和对疗法的响应性的方法

说明书

本发明提供了试剂盒和方法，其用于确定对象是否患有肝脏疾病，和/或对象是否将对用于肝脏疾病的疗法响应。本发明公开的方法包含确定从所述对象的体液中分离的外泌体的miR图谱。

相关申请的交叉引用

本申请根据35 U.S.C. § 119(e)要求2015年09月29日提交的美国临时申请号62/234,581的利益，前述申请的全部内容以引用的方式并入本文中。

联邦经费的声明

本发明在由国家卫生研究院（NIH）的国家酒精滥用和酒精中毒研究所（NIAAA）授予的经费号1R01AA021276-01的政府支持下做出。在本发明中政府具有一定权利。

背景技术

肝、肺、肾、心以及其他重要器官系统的慢性瘢痕形成或“纤维化（fibrosis）”没有有效的治疗，并且据估计在工业化社会中占了高达45%的总死亡数。目前没有FDA或EMEA批准的抗纤维化的疗法。

在许多慢性肝纤维化疾病中纤维化是常见的并且使人衰弱的病理，其阻碍有效的治疗并且加剧了对于肝移植的需求。肝脏纤维化是对在肝中的慢性损伤和炎症的常见响应，其导致不溶的胶原及细胞外基质成分的过量生成与沉积。

肝纤维化正影响着550万的美国成年人（即2-3%的美国成年人口），其是严重的医学问题，因为它危及了正常的肝脏结构及功能并且是肝硬化、肝癌和末期肝病的先兆。尽管儿童群体也可以被影响（先天性的胆道闭锁），但肝纤维化最常见于患有慢性肝损伤（肝炎和酒精滥用）的患者。随着目前肥胖相关的健康问题（例如脂肪肝）的激增，在有风险患有肝纤维化或已经发展出肝纤维化的患者数量上的大幅增加是预料之中的。存在着许多其他类型的瘢痕形成缺乏有效的治疗。例如，皮肤瘢痕形成和腹腔粘连以高比例出现在美国每年进行的4200万例手术中，但同样没有FDA-批准的药物治疗以预防或减少瘢痕。据估计仅这一市场就有40亿美元。

因此，存在着对于检测肝脏纤维化的有效方法的需求。此外，存在着对于肝脏纤维化的非侵入性的检测的需求，并且存在着对于用于确定对象是否对纤维化治疗响应的有效方法的需求。本发明满足了这些需求并且还提供了相关的优点。

概述

本发明提供了用于纤维化（例如肝脏纤维化）的诊断的方法，以及用于确定肝脏纤维化对疗法的响应性的方法，其中每个都是未被满足的医疗需求。如本文在此更详细地公开的，本发明提供了用于确定对象是否患有纤维化或肝疾病的方法，所述方法包括在从所述对象的体液中分离的外泌体（exosome）的样品中，确定在表1和表2中列出的一种或多种miRNA的表达水平，其中与对照相比，一种或多种miRNA的至少两倍或更高的差异表达，表明所述对象患有纤维化的疾病或肝疾病。在一个方面，患有疾病（例如肝疾病）的对象的外泌体具有独特的分子图谱，其独特之处在于所述外泌体的microRNA（miR或miRNA）图谱包含与健康的对照对象的外泌体的miR图谱相比的差异表达（例如至少两倍）。在一些实施方式中，所述肝疾病是肝的硬化。在一些实施方式中，所述对象感染有B型肝炎病毒（乙型肝炎病毒）。