[发明专利]基因表达的调节与蛋白质表达失调的筛选

说明书

本公开包括利用无义介导的RNA衰变转换外显子(NSE)的激活剂或者阻遏剂调节蛋白质表达的组合物和方法。在一些实施方案中，本文还包括使用靶向转座元件的药剂调节蛋白质表达的组合物和方法。

交叉引用

本申请要求于2015年10月9日提交的英国专利申请第1517937.7号以及于2016年8月31日提交的英国专利申请第1614744.9号的权益，其每个通过引用整体并入本文。

背景技术

ATM蛋白属于PI3/PI4-激酶家族，参与神经系统和免疫系统的发育。ATM蛋白激酶在DNA损伤时被激活并随后协调DNA修复机制。

发明内容

在某些实施方案中，本文描述了筛选对功能性ATM蛋白质缺陷和相关病症易感的个体的方法，选择用于治疗的个体的方法，用于治疗或预防与功能性ATM蛋白质缺陷相关的病症的方法，修饰对DNA损伤放疗和化疗的细胞易感性的方法，治疗癌症的方法以及相关的组合物和试剂盒。

在某些实施方案中，本文公开了筛选对功能性ATM蛋白质缺陷易感的个体的方法，其中所述筛选包括确定位于相对于人基因组的NSE(ATM内含子28中的隐蔽外显子)的3'剪接位点的位置-3处的非胸腺嘧啶变体残基rs609261的存在，其中非胸腺嘧啶变体残基rs609261的存在表明所述个体具有功能性ATM蛋白质缺陷或对其易感。在一些实施方案中，NSE包含序列tctacaggttggctgcatagaagaaaaag。

在一些实施方案中，NSE阻遏剂被布置为与序列agTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag；或tcttagTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag；或tctcagTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag内的NSE结合。在一些实施方案中，NSE阻遏剂被布置为结合ATM内含子28中的NSE或其5'或3'剪接位点。

在某些实施方案中，本文公开了一种选择个体进行治疗的方法，其中所述个体对功能性ATM蛋白质缺陷易感，所述方法包括确定位于相对于人类基因组的NSE(ATM内含子28中的隐蔽外显子)的3'剪接位点的-3位置的非胸腺嘧啶变体残基rs609261的存在，其中非胸腺嘧啶变体残基rs609261的存在表明个体具有功能性ATM蛋白质缺陷或对功能性ATM蛋白质缺陷易感，以及选择这样的个体用增加个体的功能性-ATM水平的药剂进行治疗。在一些实施方案中，所述方法进一步包括施用所述药剂以治疗所选个体。在一些实施方案中，所述药剂包含NSE阻遏剂。在一些实施方案中，NSE包含序列tctacaggttggctgcatagaagaaaaag。在一些实施方案中，NSE阻遏剂被布置为与序列agTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag；或tcttagTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag；或tctcagTCTACAGGTTGGCTGCATAGAAGAAAAAGgtagag内的NSE结合。在一些实施方案中，NSE阻遏剂被布置为结合ATM内含子28中的NSE或其5'或3'剪接位点。