[发明专利]微生物的识别方法在审

专利信息
申请号: 201680084038.9 申请日: 2016-03-31
公开(公告)号: CN109154018A 公开(公告)日: 2019-01-04
发明(设计)人: 田村广人;山本奈保美;加藤晃代;岛圭介;船津慎治 申请(专利权)人: 株式会社岛津制作所;学校法人名城大学
主分类号: C12Q1/04 分类号: C12Q1/04;G01N27/62;C12N15/09
代理公司: 上海立群专利代理事务所(普通合伙) 31291 代理人: 侯莉;毛立群
地址: 日本国*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: 标记蛋白质 微生物 李斯特菌 菌种 读取 核糖体蛋白质 质荷比 质谱 质量分析 再现性
【权利要求书】:

1.一种微生物的识别方法,其特征在于,具有:

a)对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;

b)读取步骤,从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z;

c)识别步骤,基于所述质荷比m/z,对所述试样所含的微生物含有李斯特菌的哪一个菌种进行识别,

使用17种核糖体蛋白质L3、L4、L23、L2、L24、L6、L18、S5、L15、S13、S11、L10、L21、L13、S9、L31以及S16中的至少一种作为所述标记蛋白质。

2.如权利要求1所述的微生物的识别方法,其特征在于,

使用8种核糖体蛋白质L24、L6、L18、L15、S11、S9、L31以及S16的至少一种作为所述标记蛋白质。

3.如权利要求1或者权利要求2所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述李斯特菌的菌种为单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)、英诺克李斯特菌(Listeria innocua)、威尔斯李斯特菌(Listeria welshimeri)、西尔李斯特菌(Listeria seeligeri)、伊氏李斯特菌(Listeria ivanovii)、格氏李斯特菌(Listeriagrayi)以及Listeria rocourtiae的任一种。

4.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述识别步骤,至少基于以下质荷比,对所述微生物中是否含有单核细胞增生李斯特菌进行识别:分别源自核糖体蛋白质L15、S11以及S9的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L24、L6、L18以及S9的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质S11、S9、L31以及S16的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L18、S9、L31以及S16的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L18、L15以及S9的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L24、L6、S11以及S9的峰的质荷比m/z。

5.如权利要求4所述的微生物的识别方法,其特征在于,

在识别出所述微生物中含有单核细胞增生李斯特菌时,所述识别步骤,进而基于源自核糖体蛋白质S9的峰的质荷比m/z、与源自核糖体蛋白质L24以及L6的至少一种的峰的质荷比m/z,识别该单核细胞增生李斯特菌的谱系。

6.如权利要求5所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述识别步骤,至少基于源自核糖体蛋白质S16的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L15以及L31的峰的质荷比m/z,识别所述微生物中是否含有英诺克李斯特菌。

7.如权利要求6所述的微生物的识别方法,其特征在于,

在识别出所述微生物中含有英诺克李斯特菌时,所述识别步骤进而至少基于源自核糖体蛋白质L18的峰的质荷比m/z,对该英诺克李斯特菌的菌株进行确定。

8.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述识别步骤,至少基于分别源自核糖体蛋白质L18、S16的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L18、L31的峰的质荷比m/z,识别所述微生物中是否含有核糖体蛋白质的质荷比的图形与英诺克李斯特菌的模式菌株近似的组的菌株。

9.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述识别步骤,至少基于分别源自核糖体蛋白质L18、S16的峰的质荷比m/z、或者分别源自核糖体蛋白质L18、L31的峰的质荷比m/z,将所述微生物所含的菌株,分类成核糖体蛋白质的质荷比的图形与英诺克李斯特菌的模式菌株近似的组或者非近似的组。

10.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,

所述识别步骤,至少基于源自核糖体蛋白质S9以及L31的峰的质荷比m/z,对所述微生物中是否含有伊氏李斯特菌进行识别。

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