[发明专利]人类Y染色体29个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及分子遗传学领域，具体来说是一种人类Y染色体29个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒。

背景技术

短串联重复序列基因座(Short Tandem Repeat，STR) 遗传标记又称微卫星 DNA，其广泛存在于原核及真核生物基因组中，是一类由2-6个核苷酸为重复单元组成的几十至一百多个的核苷酸重复序列,不同数目的核心序列呈中联重复排列,而长度呈现多态性,根据两端保守性序列，设计引物，进行 PCR，然后通过聚丙烯酰胺、琼脂糖凝胶电泳或毛细管电泳等检测 STR遗传标记的多态性 ,STR标记与其他遗传标记物相比，STR基因座片段小、容易扩增,更适用于微量和降解检材，各基因座的扩增条件相近而能够复合扩增,因而具有快速、高效、准确、灵敏、信息量大等优点,尤其是在建立DNA数据库方面，与以往RFLP等技术相比，STR复合扩増技术具有极大的优越性 。

Y染色体STR遗传标记是指存在于人类Y染色体非重组区域的短串联重复序列 ,目前，以各种形式确认并命名的Y-STR基因座己有220多个，将己发现的Y染色体STR遗传标记与常染色体STR遗传标记相比，大多数Y染色体STR遗传标记具有复杂重复结构，含有两种或两种以上的不同重复单位，群体中个体的核心重复序列或重复次数不同，形成群体遗传多态性,Y染色体STR遗传标记具有男性特有、父系遗传及单倍型造传等三大特征，将其独特性与STR位点分型检测的优越性相结合，可进行法医学个体识别、亲子鉴定及DNA家谱构建等。

法医上将突变率高于1 %的基因座称为快速突变基因座(Rapidly Mutating Y- STR) ,快速突变基因座具有较高的相关男性区分能力，而且一般具有较高的多态性,但基因座突变率较高会干扰某些情况的Y-STR家系排査。

目前法医上利用Y-STR进行建库,主要功能是家系排査,缩小嫌疑人范围，而非认定嫌疑人 ,在中国,特别是农村，主要是家族聚居的方式,在Y-STR建库的实际操作过程中， 往往只对一个大家族中一个或者几个成员进行采样建库,这样在花费较小的情况下就能利用Y-STR快速缩小侦査范围，然后通过比对常染色体STR,对嫌疑人进行认定,由于Y-STR建库釆样的一个或几个人即代表了整个家系的Y-STR信息，这就存在一种不利的情況：嫌疑人属于此家系一员，但与建库对象Y-STR有3个或更多基因座分型不一致，此时容易将嫌疑人所属的真实家系排除,如果建库试剂盒中快速突变基因座较多，那么这种可能性会变得非常高 ,另一方面，由于Y-STR建库主要目的不是认定嫌疑人，不需要区分相关男性，因而快速突变基因座的优势在这里用处不大,所以，不建议在这种情况下使用快速突变率的基因座,然而，低突变率基因座往往多态性较低，不利于家系之间的区分 ,因此,需要基因座的数量要多，同时基因座的多态性要高，以保证Y-STR试剂金具有足够高的整体多态性 。

目前市场上主流的商品化试剂盒通常采用的是五色荧光检测技术,但随着Y-STR建库市场的扩大,现有的Y-STR试剂盒已无法满足目前市场的需求，市场急需一个的个体别率更高，检测基因座数更多的 Y-STR试剂盒,是STR荧光检测试剂盒的必然趋勢。

市面上主流试剂盒有Yfiler、Yfiler Plus、PowerPlexY23、Goldeneye Y26、 STRtyper27Y、AGCU Database Y24等荧光检测试剂盒,基因座数量分别为17个、27个、23个、26个、27个、24个,法医学常用的 Yfiler的基因座数量较少，累积个体识别率较低，Yfiler已被确认在某些特定的人群中具有非常低的多态性, Yfiler P1us、STRtyper 27Y 、powerplex Y23、Goldeneye Y26分别含有7个、7个、2个和3个快速突变基因。

发明内容

本发明的目的是为了解决现有技术中的累积个体识别率较低、具有等位基因越界的风险的缺陷，提供一种人类Y染色体29个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒来解决上述问题。