[发明专利]一种基因转录产物的检测方法及其应用在审

专利信息
申请号: 201710014481.5 申请日: 2017-01-07
公开(公告)号: CN108285923A 公开(公告)日: 2018-07-17
发明(设计)人: 谢建辉;张雅琪 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 检测 基因转录产物 法医学 基因检测技术 来源鉴定 生物检材 环状RNA 信使RNA 基因 应用
【权利要求书】:

1.一种基因转录产物的检测方法,其特征在于,其包括:使用引物对同时检测同一基因转录的信使RNA和环形RNA。

2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述引物对是根据同一基因转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域设计,并通过聚合酶链反应筛选获得。

3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述的同一基因转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域,通过一代测序、二代测序或联合测序途径获得。

4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的基因为ALAS2和/或MMP7。

5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的基因为ALAS2和MMP7。

6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述的基因还包括血红蛋白亚基α(HBA)、血红蛋白亚基β(HBB)、基质金属蛋白酶10(MMP10)、基质金属蛋白酶11(MMP11)、左右决定因子2(LEFTY2)基因中的一种或多种。

7.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述引物对为SEQ ID NO: 1和/或SEQ ID NO: 2。

8.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述引物对为SEQ ID NO: 1和SEQ ID NO: 2。

9.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述的共同含有的核酸序列区域为SEQ ID NO: 3和/或SEQ ID NO: 4。

10.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述的核酸序列区域为SEQID NO: 3和SEQ ID NO: 4。

11.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO:1引物对对ALAS2转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域为SEQ ID NO: 3。

12.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO: 2引物对对MMP7转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域为SEQ ID NO: 4。

13.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO: 1引物对和SEQ ID NO: 2引物对分别对ALAS2和MMP7转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域分别为SEQ ID NO: 3和SEQ ID NO: 4。

14.一种引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包含的引物对序列为SEQ ID NO: 1和/或SEQ ID NO: 2。

15.一种引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包含的引物对序列为SEQ ID NO: 1和SEQ ID NO: 2。

16.根据权利要求14或15所述的引物组合物,其特征在于,每个引物对中至少有一条引物的5’端被荧光分子标记。

17.根据权利要求16所述的引物组合物,其特征在于,所述的荧光分子选自Fluorescein、JOE、TMR-ET、CXR-ET、PET、NED、VIC或6’-FAM。

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