[发明专利]一种基因转录产物的检测方法及其应用在审
申请号: | 201710014481.5 | 申请日: | 2017-01-07 |
公开(公告)号: | CN108285923A | 公开(公告)日: | 2018-07-17 |
发明(设计)人: | 谢建辉;张雅琪 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 基因转录产物 法医学 基因检测技术 来源鉴定 生物检材 环状RNA 信使RNA 基因 应用 | ||
1.一种基因转录产物的检测方法,其特征在于,其包括:使用引物对同时检测同一基因转录的信使RNA和环形RNA。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述引物对是根据同一基因转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域设计,并通过聚合酶链反应筛选获得。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述的同一基因转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域,通过一代测序、二代测序或联合测序途径获得。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的基因为ALAS2和/或MMP7。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述的基因为ALAS2和MMP7。
6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述的基因还包括血红蛋白亚基α(HBA)、血红蛋白亚基β(HBB)、基质金属蛋白酶10(MMP10)、基质金属蛋白酶11(MMP11)、左右决定因子2(LEFTY2)基因中的一种或多种。
7.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述引物对为SEQ ID NO: 1和/或SEQ ID NO: 2。
8.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述引物对为SEQ ID NO: 1和SEQ ID NO: 2。
9.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述的共同含有的核酸序列区域为SEQ ID NO: 3和/或SEQ ID NO: 4。
10.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,所述的核酸序列区域为SEQID NO: 3和SEQ ID NO: 4。
11.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO:1引物对对ALAS2转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域为SEQ ID NO: 3。
12.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO: 2引物对对MMP7转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域为SEQ ID NO: 4。
13.根据权利要求1-6任一所述的检测方法,其特征在于,使用SEQ ID NO: 1引物对和SEQ ID NO: 2引物对分别对ALAS2和MMP7转录的信使RNA和环形RNA共同含有的核酸序列区域进行检测,所述的核酸序列区域分别为SEQ ID NO: 3和SEQ ID NO: 4。
14.一种引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包含的引物对序列为SEQ ID NO: 1和/或SEQ ID NO: 2。
15.一种引物组合物,其特征在于,所述引物组合物包含的引物对序列为SEQ ID NO: 1和SEQ ID NO: 2。
16.根据权利要求14或15所述的引物组合物,其特征在于,每个引物对中至少有一条引物的5’端被荧光分子标记。
17.根据权利要求16所述的引物组合物,其特征在于,所述的荧光分子选自Fluorescein、JOE、TMR-ET、CXR-ET、PET、NED、VIC或6’-FAM。
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