[发明专利]一种基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法在审
申请号: | 201710050670.8 | 申请日: | 2017-01-23 |
公开(公告)号: | CN106755490A | 公开(公告)日: | 2017-05-31 |
发明(设计)人: | 张轲;陈丹;张冀武;杨青;孙浩巍;龙杰;张晓伟;王怡海;张家瑞;周继月;李锦辉;杨艺敏;陈茂建;张庆刚 | 申请(专利权)人: | 云南省烟草质量监督检测站 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京创遇知识产权代理有限公司11577 | 代理人: | 李芙蓉,冯建基 |
地址: | 650106 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 分子 标记 烟叶 品种 纯度 抽样 检测 方法 | ||
1.一种基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于包括以下步骤:
步骤A:针对不同烤烟品种,进行亲本的SSR引物筛选,筛选出不同品种间有差异的SSR引物;
步骤B:根据产烟区和待抽检烟叶的量,确定抽检批次;
步骤C:从每批次的样品中随机抽取100片初烤烟叶,重复取样3次,总共取样数量为300片,重复样品用于补缺检测或复检;
步骤D:提取步骤C中的样品初烤烟叶的基因组DNA;
步骤E:对所述样品初烤烟叶的基因组DNA进行质量评价;
步骤F:利用被检测的样品初烤烟叶品种的SSR引物进行PCR检测;
步骤G:对PCR扩增产物进行检测;
步骤H:对检测的结果进行分析计算,确定品种纯度合格率。
2.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤B中,抽检批次应覆盖所有产烟区,抽检的批次按照2万担/批次进行抽取,产量低于2万担的产烟区,不少于1批次。
3.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤D中,所述基因组DNA提取的步骤如下:
步骤D1:对抽取的样品初烤烟叶烘干,并研磨粉碎至烟叶粉末;
步骤D2:取所述烟叶粉末70-100mg,并加入300-500μl裂解液,65℃水浴10-30min,加入100-200μl提取液,室温放置2-10min,12000r/min离心8-15min,取上清液加入96孔深孔板;
步骤D3:利用BioMek NXp自动化工作站进行DNA提取。
4.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤E中,通过紫外吸收法对所提取的DNA进行检测,当在260nm处有明显的吸收峰时,所述DNA质量合格。
5.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤F中,SSR标记PCR扩增反应体系为:
10×PCR buffer,1.25μl;
dNTP,0.2μl;
TaqDNA polymerase,0.2μl;
灭菌水,6.95μl;
正向引物,0.2μl;
反向引物,0.2μl;
模板DNA,1μl。
6.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度检测抽样方法,其特征在于,
所述步骤F中,PCR反应程序为:94℃预变性5min后,进入35个循环,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸7min,35个循环结束后72℃延伸10min,16℃保存。
7.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤G中,所述PCR扩增产物通过聚丙烯酰胺电泳进行检测。
8.根据权利要求7所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述步骤H中,对检测的结果进行分析计算时,品种纯度合格率=抽检合格批次/抽检总批次×100%。
9.根据权利要求1所述的基于DNA分子标记的初烤烟叶品种纯度抽样检测方法,其特征在于,
所述烤烟品种为红花大金元、K326、云系。
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