[发明专利]镰刀菌病病原菌RT-PCR检测引物和探针组合及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201710061639.4 申请日: 2017-01-26
公开(公告)号: CN106868114B 公开(公告)日: 2020-01-07
发明(设计)人: 龚杰;张雯;吴伟伟;陈见友;陆捷洁;韩娜;张婷婷;黎青山 申请(专利权)人: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/77
代理公司: 11002 北京路浩知识产权代理有限公司 代理人: 王文君
地址: 102206 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 镰刀 病原菌 rt pcr 检测 引物 探针 组合 试剂盒
【权利要求书】:

1.含有镰刀菌病病原菌RT-PCR检测引物和探针组合的用于实时荧光定量PCR检测镰刀菌病病原菌的试剂盒,其特征在于,所述镰刀菌病病原菌RT-PCR检测引物和探针组合包括:

(I)用于检测镰刀菌的通用引物和探针,所述镰刀菌包括茄病镰刀菌、串珠镰刀菌和尖孢镰刀菌

Fpan-F:5′-GCCCGAGTTGTAATTTGTAGAG-3′

Fpan-R:5′-AACCAGACGGGGCTCTCAC-3′

Fpan-P:5′-FAM-GGTGCCTTCCGAGTTCCCTGG-BHQ1-3′

(II)用于检测串珠镰刀菌的特异性引物和探针

Fmon-F:5′-CGCATGAGTGTTTACTTCAACG-3′

Fmon-R:5′-AGGTCGACGAGGACGGCT-3′

Fmon-P:5′-FAM-AGCAGTCAA[T]G[T]CAAGAGTTCA-BHQ1-3′;

其中,[T]表示锁核酸;

(III)用于检测茄病镰刀菌的特异性引物和探针

Fsol-F:5′-GCATGAGCGTCTACTTCAAC-3′

Fsol-R:5′-AAGGGACCAGCACGAACG-3′

Fsol-P:5′-FAM-AGCTGACATCTGTAGGCTTCTGGTAA-BHQ1-3′;以及

(IV)用于检测尖孢镰刀菌的特异性引物和探针

Foxy-F:5′-TGTCTACTTCAACGAGGTATGC-3′

Foxy-R:5′-CATGGTACCAGGCTCAAGAT-3′

Foxy-P:5′-FAM-AATTCCCAAGCTCACACAACTAGG-BHQ1-3′;

所述试剂盒还包括竞争性内参模板Fpan-IAC、Fmon-IAC、Fsol-IAC、Foxy-IAC和内参探针Fu-IACP,其序列信息如下:

Fpan-IAC:5′-GCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGCTAGATGACTGAGCACGTCTATCCGATGATCATGGTGAGAGCCCCGTCTGGTT-3′

Fmon-IAC:5′-CGCATGAGTGTTTACTTCAACGCTAGATGACTGAGCACGTCTATCCGATGATCATGAGCCGTCCTCGTCGACCT-3′

Fsol-IAC:5′-GCATGAGCGTCTACTTCAACCTAGATGACTGAGCACGTCTATCCGATGATCATGCGTTCGTGCTGGTCCCTT-3′

Foxy-IAC:5′-TGTCTACTTCAACGAGGTATGCCTAGATGACTGAGCACGTCTATCCGATGATCATGATCTTGAGCCTGGTACCATG-3′

Fu-IACP:5′-TAMRA-ACTGAGCACGTCTATCCGA-BHQ1-3′;

所述试剂盒还包括真菌DNA提取液和/或玻璃珠;

所述真菌DNA提取液的配方如下:

所述玻璃珠为直径710-1180μm的酸洗玻璃珠。

2.用于非疾病诊断目的检测镰刀菌病病菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)提取待测样品的DNA;

2)以上述提取的DNA为模板,利用权利要求1所述试剂盒,分别进行实时荧光定量PCR扩增;

3)分析PCR扩增产物。

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