[发明专利]一种基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法有效
申请号: | 201710062737.X | 申请日: | 2017-01-25 |
公开(公告)号: | CN106970229B | 公开(公告)日: | 2018-11-16 |
发明(设计)人: | 周学敏;李昺之;徐磊;陈月;朱婉莹;沈心;洪俊丽 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68 |
代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 尹慧晶 |
地址: | 210029 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 纳米 分子 信标 核酸外切酶 iii 循环 信号 放大 转录 因子 检测 方法 | ||
1.一种基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于检测方法包括如下步骤:
a)将单链DNA reporter与其互补单链s-reporter在Tris-Ac缓冲液中杂交形成双链探针dsNF-κB p50 probe;在步骤a)之前,配置Tris-Ac缓冲液,具体配方是10mM Tris-Ac,0.1mM EDTA, 100mM NaAc;
b) 10μL,50nM的dsNF-κB probe与体积都是5μL的30nM-2500nM的转录因子NF-κB p50的溶液混合,随后加入3μL,10U/μL的Exo III,在37℃下反应30min;反应缓冲体系:10mMTris–Ac, pH7.5, 100mM KCl,2mM MgCl2, 0.1mM EDTA, 10%(v/v)glycerol,30min后,向上述反应体系中加入20μL,1μM的AgMBs,37℃下反应2h;
c)测定样品在561nm激发波长下,620nm处的荧光值,利用测得的I620的值,获得转录因子浓度与荧光强度的线性关系;
d)从实际细胞或组织样品中获得核蛋白提取物作为待测样品,根据步骤c)所得到的线性关系与待测样品获得的荧光强度,得到待测样品中转录因子的浓度;
其中,
Reporter:GAGGGGACTTTCCCAGCCCCACCCCACCCCACCCTCGTCATCAGATACTTA
s-reporter:ATCTGATGACGAGGGTGGGGTGGGGTGGGGCTGGGAAAGTCCCCTC
制备AgMBs时所用的AgMBs模板的序列为:
CCCTTAATCCCCTCGTCAATGCGATCTGATGACGAGGGTGGGGTGGGGTGGGG。
2.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于:步骤a)具体为:用Tris-Ac缓冲液溶解冻干的寡核苷酸,得到100μM的reporter与s-reporter,随后将二者等体积涡旋,加热至95℃,维持10min后缓慢降温至室温,降温过程维持至少一小时。
3.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于,步骤b)所述的AgMBs是通过以下步骤制备得到的:将1OD的AgMBs模板溶解于975μL缓冲液中,加热至95℃,维持10min后缓慢降温至37℃,降温持续时间为1h,随后加入12μL,10mM新制硝酸银溶液,涡旋混合后避光4℃反应30min,接着,迅速加入12μL,10mM新制硼氢化钠溶液,充分振摇混合1min,然后避光4℃反应过夜;其中,所述的缓冲液中为10mM Na2HPO4/NaH2PO4,100mMCH3COONa,5 mM Mg(CH3COO)2, pH7.5。
4.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于,步骤c)具体为:将样品低速离心后,装入石英比色皿进行荧光检测,检测条件是激发波长为561 nm,扫描速度为1200 nm min-1,光电倍增管电压为700 V,激发狭缝和发射狭缝宽度为5 nm。
5.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于,模型转录因子为NF-κB p50。
6.根据权利要求1所述的基于DNA-银纳米簇分子信标与核酸外切酶III循环信号放大的转录因子检测方法,其特征在于,转录因子NF-κB p50的浓度范围是30pM-2.5nM。
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