[发明专利]苋属的实时荧光PCR鉴定方法有效
申请号: | 201710098669.2 | 申请日: | 2017-02-23 |
公开(公告)号: | CN106801102B | 公开(公告)日: | 2020-11-20 |
发明(设计)人: | 林晓佳;吴姗;陈吴健;虞惠贞;任琰 | 申请(专利权)人: | 浙江省检验检疫科学技术研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686 |
代理公司: | 上海智力专利商标事务所(普通合伙) 31105 | 代理人: | 周涛 |
地址: | 310012 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 实时 荧光 pcr 鉴定 方法 | ||
1.一种苋属的实时荧光PCR鉴定方法,其特征在于,该鉴定方法包括以下步骤:
步骤1,苋属DNA提取:
取样本2g,液氮研磨至粉末状,取0.2g研磨后的粉末状样品用试剂盒提取DNA,将提取到的DNA溶解在50μL去离子水中,将得到的DNA样品置于-20℃冰箱保存、备用;
步骤2,特异性引物和探针的设计:
基于叶绿体的PsbA基因,设计选取具有苋属特异性的引物和探针,所述特异性引物和探针分别为:
F:AGGAGCAATGCCGTTTTCTT,
R:CAGTATTCAGAACTTGCCTTTGA,
P:FAM-TGTCAAGAAATTGGTTATTGCTCC-Eclipse,
步骤3,TaqMan实时荧光PCR:
将步骤2设计选取的引物和探针对步骤1中的DNA样品进行荧光PCR扩增反应,通过荧光PCR扩增后得到Ct值,通过Ct值对样品是否含有苋属进行判定。
2.根据权利要求1所述的苋属的实时荧光PCR鉴定方法,其特征在于,所设计的引物和探针对苋属具有物种的特异性,能用于苋属的鉴定。
3.根据权利要求1所述的苋属的实时荧光PCR鉴定方法,其特征在于,所述步骤3中实时荧光PCR扩增反应体系如下:10μL Premix Ex Taq,10pmol/μL的上游引物0.4μL,10pmol/μL的下游引物0.4μL,10pmol/μL的探针0.4μL,取上述提取得到DNA液2μL,用去离子水补足体积至20μL,应用荧光定量PCR仪进行反应,反应程序为(1)95℃,10sec;(2)95℃,5sec;62℃,23sec;40个循环,所述实时荧光PCR均重复三次,取三次结果的平均Ct值,当平均Ct值>35.0或无Ct值,则判定为阴性,当Ct值≤35.0,则判定为阳性。
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