[发明专利]用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP引物及检测方法在审
申请号: | 201710100771.1 | 申请日: | 2017-02-23 |
公开(公告)号: | CN106591498A | 公开(公告)日: | 2017-04-26 |
发明(设计)人: | 罗宝正;薄清如;邵建宏;赵宇清;沙才华;廖秀云;陈轩;黄海超 | 申请(专利权)人: | 珠海出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京国坤专利代理事务所(普通合伙)11491 | 代理人: | 姜彦 |
地址: | 519015 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 水疱 口炎 病毒 荧光 lamp 引物 方法 | ||
1.一种用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP引物,其特征在于,所述用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP引物序列为:SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6。
2.一种如权利要求1所述用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP引物的合成方法,其特征在于,所述合成方法包括:
根据GenBank数据库中水疱性口炎病毒的基因序列,选取其NP基因上的一段高度保守区作为扩增对象,使用分子生物学软件LAMP designer1.14设计实时荧光LAMP引物,采用HPLC方式进行纯化,并将合成后的引物用灭菌DEPC水稀释成100μmol/L溶液,保存于-20℃。
3.一种利用权利要求1所述用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP检测方法,其特征在于,所述用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP检测方法包括以下步骤:
步骤一,样品的核酸提取:按照核酸提取试剂盒Mag-Bind Viral DNA/RNA Kit说明书提取样品核酸;
步骤二,反应管中成分配制:LAMP反应体系总体积为25μL,其中2×Taq反应液RM 12.5μL,40μmol/L的内引物FIP和BIP各1μL,20μmol/L的环引物LF和LB各1μL,5μmol/L的外引物F3和B3各1μL,Bst DNApolymerase 0.8μL,逆转录酶0.2μL,病毒核酸2.0μL,补水至25.0μL;最后加20.0μL的封闭液以避免体系挥发和产物污染;
步骤三,仪器检测:在荧光PCR仪上反应条件调整为保温阶段63℃30s,1个循环;循环阶段63℃15s,63℃45s,60个循环;于63℃45s处收集荧光信号,荧光通道选为FAM。
4.如权利要求3所述的用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP检测方法,其特征在于,所述用于检测水疱性口炎病毒的荧光LAMP检测方法的内引物FIP和BIP浓度为1.6μmol/L、外引物F3和B3浓度为0.2μmol/L、环引物LF和LB浓度为0.8μmol/L,反应温度为63℃。
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