[发明专利]一种稻瘟病抗性基因Piz‑t功能特异性分子标记及其检测方法和应用

权利要求书

1.一种稻瘟病抗性基因Piz-t功能特异性分子标记，其特征在于所述分子标记是通过引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组DNA中扩增出与稻瘟病抗性基因Piz-t呈特异性带型的分子标记，所述引物对序列为：

SEQ ID NO.1Fl：5’-TTACTAGAATCGCTCCAT-3’；

SEQ ID NO.2Rl：5’-ACTGCGTGCGACTTGA-3’。

2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于所述与稻瘟病抗性基因Piz-t呈特异性带型的分子标记的序列如SEQ ID NO.3所示。

3.检测权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Piz-t的功能特异性分子标记的方法，其特征在于：通过比对多个水稻稻瘟病抗性基因Piz-t的等位基因序列,包含以下步骤:

(1)从公共数据库中下载得到的Piz-t及其同源的基因组序列，以及测序品种日本晴相对应区域的基因组序列，针对Piz-t位点进行序列比对，筛查Piz-t特异的、能区别于该位点其他稻瘟病等位抗性基因的插入/缺失(insertion-deletion,InDel)位点；

(2)利用步骤(1)获得的InDel信息，根据InDel标记的设计原理，在所述InDel位点处上下游处设计基因特异性引物，引物对碱基序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；

(3)以携带有稻瘟病抗性基因Piz-t的稻瘟病抗性品种IRBLZT-T的总DNA为模板，进行PCR扩增，所获得的PCR产物即为稻瘟病抗性基因Piz-t基因特异性分子标记Piz-t-InDel。

4.权利要求1或2所述的稻瘟病抗性基因Piz-t基因特异性分子标记在鉴别水稻品种稻瘟病抗性基因中的应用。

5.权利要求1或2所述的稻瘟病抗性基因Piz-t基因特异性分子标记在鉴别Pi2/Pi9基因簇区域不同的稻瘟病抗性基因中的应用。

6.一种鉴别水稻品种稻瘟病抗性基因的试剂盒，其特征在于含有核酸序列如SEQ ID NO.3所示的分子标记，以及如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所述的引物对。