[发明专利]检测山核桃干腐病病菌的环介导等温扩增方法有效

专利信息
申请号: 201710124909.1 申请日: 2017-03-03
公开(公告)号: CN106868142B 公开(公告)日: 2021-04-23
发明(设计)人: 戴德江;童琪;张佳星;张传清 申请(专利权)人: 浙江农林大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 金祺
地址: 311300 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 山核桃 干腐病 病菌 环介导 等温 扩增 方法
【权利要求书】:

1.用于检测山核桃干腐病病菌的环介导等温扩增方法,其特征在于:

LAMP引物组合物由以下4条引物组成:

上游外引物F3:5’—CGCGTTCAGAAGATTGCCATA—3’;

下游外引物B3:5’—TTGTTGCCAAAACACCCGC—3’;

上游内引物FIP:5’—GCGTGGGAGAACATCAATGAC-GCTCGAGCTGAAGGTCCG—3’;

下游内引物FIB:5’—CTTACACGCCAGAGCCGT-AACGCGAATCGACACCACAG—3’;

25μL反应体系由以下成分组成:8 U/μL Bst DNA聚合酶0.5 μL、10×ThermoPolBuffer 2.5 μL、20 μM FIP 2.0 μL、20 μM FIB 2.0 μL、10 μM F3 0.5 μL、10 μM B3 0.5μL、25 mM MgCl2 4.0 μL、10 mM dNTPs 2.5 μL、5 M甜菜碱3.0 μL、3.75 mM羟基萘酚蓝1 μL、DNA模板1 μL,ddH2O补足至25 μL;

利用所述25μL检测反应体系进行LAMP扩增反应,选择以下任一方法:

方法一、先在扩增前加入染料羟基萘酚蓝作为反应指示剂,以羟基萘酚蓝的颜色变化做为结果判定标准,然后进行LAMP扩增反应,反应结束后,颜色发生变化,即显色结果观察到天蓝色判断为阳性,判定显示检测到山核桃干腐病病菌;颜色没有发生变化,显色结果仍为蓝紫色判断为阴性,判定显示样品无山核桃干腐病病菌,或所含山核桃干腐病病菌含量未达检测的最低检测浓度;

方法二、取5μL扩增产物,用2%琼脂糖凝胶电泳检测,如果出现梯形条带判断为阳性,即显示检测到山核桃干腐病病菌;无扩增条带则判断为阴性,即显示无山核桃干腐病病菌,或所含山核桃干腐病病菌未达最低检测浓度。

2.根据权利要求1所述的环介导等温扩增方法,其特征在于LAMP扩增反应程序为:65℃扩增60min; 80℃灭活10min。

3.根据权利要求2所述的环介导等温扩增方法,其特征在于:

所述方法一、方法二中的最低检测浓度均为0.01 ng/μL。

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