[发明专利]一种快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法在审
申请号: | 201710157057.6 | 申请日: | 2017-03-16 |
公开(公告)号: | CN106967796A | 公开(公告)日: | 2017-07-21 |
发明(设计)人: | 黄文;张勇;胡超群 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02;G01N21/64 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510301 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 批量 测定 水生 动物 基因组 方法 | ||
技术领域
本发明属于倍性遗传育种及检测领域,更具体地说,涉及一种快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法。
背景技术
育种是所有经济作物或动物可持续发展的重要基础。倍性育种是指利用生物学规律,在染色体组或者不同物种基因组层面上改良后代的遗传特征,得到人们想要的优良性状的育种方法。在人工条件下,阻断单倍体胚胎分裂的进程,将正常发育的单倍体胚胎诱导成正常二倍体(即雌核发育)或者阻断正常二倍体胚胎的有丝分裂,将正常发育的二倍体胚胎诱导成四倍体(即诱导四倍体)等过程就是在染色体组层面的遗传改良。远缘杂交是指利用亲缘关系在种以上的杂交育种方法,不同的物种基因组会出现不融合的现象,在远缘杂交子代中会出现多种倍性的个体。
由于多倍体个体及正常二倍体个体在外观上没有显著性的特征,无法从众多的个体中区分不同倍性个体。目前鉴定倍性的方法主要有:血细胞涂片、染色体制备及实验室流式细胞等方法。然而,现有的鉴定方法都需要对样品进行编号并带回实验室逐一鉴定,耗时较多,特别是针对大批量的水生动物后代时,无法进行批量检测。
有鉴于此,确有必要提供一种快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法。
发明内容
本发明的目的在于:克服现有测定水生动物基因组倍性时存在的操作繁琐、耗时长等问题,提供一种快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法。
为了实现上述发明目的,本发明通过取待测水生动物的父本或母本的体液或血液,以及参考物种的体液或血液,分别制成第一参考细胞悬液和第二参考细胞悬液,再取待测水生动物的体液或血液制成待测细胞悬液,通过单峰或双峰检测法,即可测定待测水生动物的基因组倍性。具体地,单峰检测法包括如下步骤:
(1)获取待测水生动物的父本或母本的体液或血液,制成第一参考细胞悬液;
(2)取步骤(1)所述第一参考细胞悬液,使用DAPI染色液染色,经荧光检测仪检测,记录第一参考细胞悬液的荧光值;
(3)抽取待测水生动物的体液或血液,制成待测细胞悬液;
(4)取步骤(3)所述待测细胞悬液,使用DAPI染色液染色,经荧光检测仪检测,记录待测细胞悬液的荧光值;
(5)将步骤(4)所述待测细胞悬液的荧光值与步骤(2)所述第一参考细胞悬液的荧光值进行比较,即可判断出待测水生动物的基因组倍性。
作为本发明快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法的一种改进,所述荧光检测仪采用可激发DAPI染料的通道。
作为本发明快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法的一种改进,所述荧光检测仪为流式细胞仪或倍性分析仪(型号:Partec Ploidy Analyser)。
双峰检测法包括如下步骤:
(1)获取待测水生动物的父本或母本的体液或血液,制成第一参考细胞悬液;
(2)取步骤(1)所述第一参考细胞悬液,使用DAPI染色液染色,经荧光检测仪检测,记录第一参考细胞悬液的荧光值;
(3)获取基因组大小已知的参考物种个体的体液或血液,制成第二参考细胞悬液;其中,基因组大小通过网址为http://www.genomesize.com/的动物基因组大小数据库中获取。
(4)取步骤(3)所述第二参考细胞悬液,使用DAPI染色液染色,经荧光检测仪检测,记录第二参考细胞悬液的荧光值;
(5)抽取待测水生动物的体液或血液,制成待测细胞悬液,将其与步骤(3)所述第二参考细胞悬液加入到装有DAPI染色液的容器中染色,经荧光检测仪检测,得到双峰直方图后记录荧光值;若无双峰直方图,则更换步骤(3)所述的参考物种;
(6)双峰直方图由参考物种的直方图和待测水生动物的直方图组成,根据两者的差距,结合步骤(2)所述第一参考细胞悬液的荧光值,即可判断出待测水生动物的基因组倍性。
作为本发明快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法的一种改进,所述荧光检测仪采用可激发DAPI染料的通道。
作为本发明快速批量化测定水生动物基因组倍性的方法的一种改进,所述荧光检测仪为流式细胞仪或倍性分析仪(型号:PartecPloidy Analyser)。
本发明中,单峰法和双峰法均有各自的优势,其中,单峰法无需制备第二参考细胞悬液,无需挑选特定的参考物种基因组,只要有待测子代父母或母本个体即可进行子代群体基因组倍性检测,但检测结果无法得到待测水生动物的基因组大小、检测结果不够直观、需要粗略估算倍性,只适用于倍性快速检测和不同倍性个体鉴别。
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