[发明专利]一种鉴定甜樱桃啤酒花矮化类病抗性的方法在审
申请号: | 201710159399.1 | 申请日: | 2017-03-17 |
公开(公告)号: | CN106868095A | 公开(公告)日: | 2017-06-20 |
发明(设计)人: | 徐丽;刘庆忠;朱东姿;宗晓娟;王甲威;魏海蓉;陈新;谭钺;张力思 | 申请(专利权)人: | 山东省果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/18 | 分类号: | C12Q1/18;C12N15/82;C12N15/40;C12N15/10;C12R1/94 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所37218 | 代理人: | 李桂存 |
地址: | 271000*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 樱桃 啤酒花 矮化 抗性 方法 | ||
1.一种鉴定甜樱桃啤酒花矮化类病抗性的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)植物总RNA的提取及引物设计:提取感病甜樱桃叶片总RNA, -80℃保存备用;
(2)HSVd全长cDNA克隆及测序:以提取的总RNA为模板,反转录试剂盒中的随机引物进行RT-PCR反转录,反应体系为20μL;以反转录得到的cDNA为模板进行PCR扩增反应,R1和F1为引物;
PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳,用快速琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(康为) 回收目的片段,将回收的片段与pGEM-T(Promega)载体连接,连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,菌液PCR筛选阳性质粒;
(3)HSVd侵染性克隆的构建:将所得分离物序列与HSVd序列进行比较,对测序正确的菌株摇菌提取质粒;以提取的质粒为模板,以4个HSVd全长片段的HSVd-F1/HSVd-R1和HSVd-F2/HSVd-R2为引物,引物对HSVd-F1/HSVd-R1用于扩增第一个片段,引物对HSVd-F2/HSVd-R2用于扩增第二个片段,利用高保真酶分别进行PCR扩增获得HSVd全长片段,电泳后切胶回收;将两个片段与载体进行重组反应,反应结束后瞬时离心,将离心管置于冰上冷却5min;重组产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,菌液PCR筛选阳性质粒;
(4)质粒接种及抗病性鉴定:将获得含有HSVd cDNA加倍串联序列的克隆质粒pGEM-HSVd-HSVd,提取质粒pGEM-HSVd-HSVd,通过茎杆注射方法进行接种甜樱桃砧木G6,同时以接种空白质粒pGEM的植株为阴性对照。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述引物对序列R1和F1如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述反转录的反应体系中含有总RNA 2μg,2×TS Reation Mix 10 μL,随机引物2 pmol,TransScriptRT/RI Enzyme Mix 1μL,加ddH2O至20 μL,混匀;42℃孵育30 min,冰上冷却2 min,-20℃保存备用。
4.根据权利要求1或3所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR扩增反应的体系为50μL,含有5×TransStart FastPfu Buffer 10μL,2.5 mM dNTPs 5μL,TransStart FastPfu DNA聚合酶1μL,引物对R1和F1各1μL (10μM), 模板2μL,加ddH2O至50μL, 混匀;PCR扩增反应程序为94℃预变性5 min;94℃变性30 s,52℃退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环;最后72℃延伸10 min。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一个片段的上游引物HSVd-F1如SEQ ID NO:3所示;,所述下游引物HSVd-R1如SEQ ID NO:4所示;所述第二个片段的上游引物HSVd-F2如SEQ ID NO:5所示;所述下游引物HSVd-R2如SEQ ID NO:6所示。
6.根据权利要求1或5的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述重组反应的体系为,pGEM-T线性化载体0.25 pmol,两个插入片段(总量)0.5 pmol,2×EasyGeno Assembly Mix 5μL,加ddH2O补足至10μL;将混合反应液置于50℃反应15 min。
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