[发明专利]一种用于高效快速扩增cDNA末端的锚定引物及扩增方法有效
申请号: | 201710159826.6 | 申请日: | 2017-03-17 |
公开(公告)号: | CN106868005B | 公开(公告)日: | 2020-07-21 |
发明(设计)人: | 蔡木炎;项志成;谢丹;王凤伟;陈杰伟;凌逸虹;李鹏 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 宋静娜;郝传鑫 |
地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 高效 快速 扩增 cdna 末端 锚定 引物 方法 | ||
1.一种用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物,其特征在于,所述5’末端锚定引物的序列末端含3个鸟嘌呤,其中前两个鸟嘌呤为单脱氧鸟嘌呤,最末端的一个鸟嘌呤为锁核酸修饰鸟嘌呤;所述5’末端锚定引物的序列自身形成3’末端部分突出的茎环状结构;所述5’末端锚定引物的序列为ATGCAGACGATTCTACGCTGTGTTCTArGrG+G。
2.如权利要求1所述的用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物,其特征在于,所述5’末端锚定引物的序列与所有物种转录本不存在特异性结合区。
3.如权利要求1所述的用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物,其特征在于,所述5’末端锚定引物的序列末端与cDNA 5’末端的胞嘧啶碱基互补配对,待M-MLV反转录酶合成cDNA至末端时,以所述5’末端锚定引物作为模板进行延伸。
4.一种高效快速扩增cDNA末端的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1~3任一项所述的用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物以及用于高效快速扩增cDNA 3’末端的锚定引物。
5.如权利要求4所述的一种高效快速扩增cDNA末端的试剂盒,其特征在于,所述用于高效快速扩增cDNA 3’末端的锚定引物序列末端连接30个dT,并且所述3’末端锚定引物序列自身不形成发夹结构;且锚定引物序列与所有物种转录本不存在特异性结合区。
6.如权利要求5所述的一种高效快速扩增cDNA末端的试剂盒,其特征在于,所述用于高效快速扩增cDNA 3’末端的锚定引物序列为CGATCTGGGCTCTGTGTTCTC-(dT)30。
7.一种采用如权利要求4-6任一所述的试剂盒高效快速扩增cDNA的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:(1)、采用所述用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物扩增目的基因的5'末端的cDNA片段,得到5'末端的RACE产物;(2)、采用用于高效快速扩增cDNA3’末端的锚定引物扩增目的基因的3'末端的cDNA片段,得到3'末端的RACE产物;(3)、从步骤(1)和步骤(2)中获得的2个有相互重叠序列的3'及5'末端的RACE产物中获得全长cDNA,或通过分析RACE产物的3'和5'端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA。
8.如权利要求7所述的一种高效快速扩增cDNA的方法,其特征在于,所述步骤(1)中得到5'末端的RACE产物的方法为:以用于高效快速扩增cDNA 5’末端的锚定引物作为上游引物,目的基因特异引物R-Primer作为下游引物,以合成的第一链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5'末端的cDNA片段扩增出来,得到5'末端的RACE产物;所述步骤(2)中得到3'末端的RACE产物的方法为:以目的基因特异引物F-Primer作为上游引物,用于高效快速扩增cDNA 3’末端的锚定引物作为下游引物,以合成的第一链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因3'末端的cDNA片段扩增出来,得到3'末端的RACE产物。
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