[发明专利]基于KCNE3和NAT2基因的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物、试剂盒及应用有效
申请号: | 201710174453.X | 申请日: | 2017-03-22 |
公开(公告)号: | CN107058527B | 公开(公告)日: | 2020-03-31 |
发明(设计)人: | 贺兆辉;申阿东;曹诗琴;晋家骧;王纯刚 | 申请(专利权)人: | 北京光大隆泰科技有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 马敬 |
地址: | 100034 北京市西城区平安里*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 kcne3 nat2 基因 结核 药物 毒性 反应 相关 snp 标志 试剂盒 应用 | ||
1.一种基于KCNE3和NAT2基因的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物,其特征在于,所述的SNP标志物包括KCNE3基因SNP位点rs12272502,以及包括NAT2基因SNP位点rs4921914、rs10103029和rs7816847中一个或多个。
2.根据权利要求1所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物,其特征在于,所述的SNP标志物还包括BLNK基因SNP位点rs2290714、PPP2R2B基因SNP位点rs1031915、FLT3基因SNP位点rs9319408、VAV2基因SNP位点rs679106、XO基因SNP位点rs1429372和IL6基因SNP位点rs2069852中一个或多个。
3.根据权利要求1或2所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物,其特征在于,所述的SNP标志物还包括NAT2基因的SNP位点rs1041983和/或rs1495741。
4.根据权利要求1或2所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物在抗结核药物肝毒性反应方面非诊断的应用。
5.根据权利要求3所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物在抗结核药物肝毒性反应方面非诊断的应用。
6.与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物在制备用于评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒中的应用,其中,所述与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物包括KCNE3基因SNP位点rs12272502,以及包括NAT2基因SNP位点rs4921914、rs10103029和rs7816847中一个或多个。
7.一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有特异于如权利要求1所述的SNP标志物的特异性扩增引物,或者含有所述特异性扩增引物和特异于如权利要求1所述的SNP标志物的特异性延伸引物。
8.根据权利要求7所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒,其特征在于,在所述的含有的特异性扩增引物中:
所述的SNP位点rs12272502的特异性扩增引物序列为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2。
9.根据权利要求8所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒,其特征在于,在所述的含有的特异性延伸引物中:
所述的SNP位点rs12272502的特异性延伸引物序列为SEQ ID No.3。
10.根据权利要求8或9所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒,其特征在于,在所述的含有的特异性扩增引物中:
所述的SNP位点s4921914的特异性扩增引物序列为SEQ ID No.22和SEQ ID No.23;
所述的SNP位点rs10103029的特异性扩增引物序列为SEQ ID No.25和SEQ ID No.26;
所述的SNP位点rs7816847的特异性扩增引物序列为SEQ ID No.28和SEQ ID No.29。
11.根据权利要求10所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒,其特征在于,在所述的含有的特异性延伸引物中:
所述的SNP位点rs4921914的特异性延伸引物序列为SEQ ID No.24;
所述的SNP位点rs10103029的特异性延伸引物序列为SEQ ID No.27;
所述的SNP位点rs7816847的特异性延伸引物序列为SEQ ID No.30。
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