[发明专利]一种基因缺失突变的高通量筛选方法在审
申请号: | 201710178492.7 | 申请日: | 2017-03-23 |
公开(公告)号: | CN106834271A | 公开(公告)日: | 2017-06-13 |
发明(设计)人: | 许安;王希楠;陈少鹏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院合肥物质科学研究院 |
主分类号: | C12N15/01 | 分类号: | C12N15/01 |
代理公司: | 合肥市浩智运专利代理事务所(普通合伙)34124 | 代理人: | 王志兴 |
地址: | 230031 安徽*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因 缺失 突变 通量 筛选 方法 | ||
1.一种基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)细胞处理及连续培养
培养两皿AL细胞至对数生长期分为对照组和处理组,即一皿不做任何处理,另一皿用1-4μg/mL亚砷酸钠连续处理12-48小时,再将对照组和处理组AL细胞各以(2.0-5.0)×105/ml细胞密度重新种植到培养皿中,连续培养6-8天;
(2)细胞收集
收取对照组和处理组AL细胞,酶解消化,悬浮于F12完全培养基中,清洗后各制成浓度为±106细胞/100μl的单细胞悬液;
(3)与荧光抗体的结合
加入80-120μl预冷的流式细胞缓冲液重悬细胞后,加入荧光标记的CD59特异性抗体,3-5℃避光反应30-60分钟后,再用预冷的流式细胞缓冲液清洗离心,去除未结合的抗体;
(4)制备上样悬液
重悬步骤(3)中所得的两组AL细胞于预冷的流式细胞缓冲液后,获取上样悬液;
(5)细胞分选
将制备得到的上样悬液送入流式细胞分选仪中,使用流式细胞微孔板分选技术进行单细胞分选;
(6)细胞扩增和图谱分析
将分选获得的单细胞突变子进行连续培养,扩增后对其突变图谱进行分析。
2.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(1)中AL细胞包括野生型AL细胞、由野生型AL细胞发展的各种缺陷型细胞以及构建的细胞系。
3.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(2)中酶解消化所用的为胰蛋白酶,为质量含量为0.25%的胰蛋白酶和0.02%EDTA溶于PBS缓冲液制得。
4.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(3)中荧光抗体的添加量为:相对±106细胞/100μl的单细胞悬液,每100μl加入10-20μl荧光抗体。
5.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(5)中使用流式细胞微孔板分选技术进行单细胞分选的具体步骤如下:
a、建立前向散射FSC/侧向散射SSC散点图,通过初步设定门P1,排除死细胞和细胞碎片,找到目标细胞群;
b、建立SSC-W/FSC-W散点图,通过二次设定门P2,排除双联体细胞;
c、建立PE-A/FSC-A荧光分析点图,根据对照细胞群位置设定阴阳性界定门,界定门以下为阴性CD59﹣细胞群,界定门以上为阳性CD59﹢细胞群。
d、对阴性CD59﹣细胞群区域进一步精确设门,利用流式细胞微孔板分选技术对精确设门区进行单细胞分选。
6.根据权利要求5所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(5)中根据界定门分选获得的两类细胞群用于连续培养或作为流式检测CD59基因突变技术中的阳性CD59﹢和阴性CD59﹣对照细胞。
7.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(5)中使用流式细胞微孔板分选技术进行单细胞分选时,使用的微孔板为流式细胞分选仪系统限定的多孔细胞培养平板。
8.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(5)中利用流式细胞微孔板分选技术进行单细胞分选时,可进行多板孔板的连续分选,最终所获的AL细胞为不同类型和程度突变引发CD59﹣表型的单细胞。
9.根据权利要求1所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述步骤(6)中突变图谱分析方法为:对每个单细胞突变子克隆11号染色体上与CD59基因物理图谱位置接近的APO-A1、CAT、WT9、PTH和RAS五个标记基因进行多重PCR扩增,分析各突变细胞的突变图谱,进一步鉴定CD59基因突变的类型和突变程度。
10.根据权利要求1-9任一所述的基因缺失突变的高通量筛选方法,其特征在于,所述单细胞突变子的前期扩增培养采用条件培养基,获取方法为:待正常野生型AL细胞长满至培养皿底65-75%时收集其培养基,经3500-4500rpm离心15-25min,0.22μm无菌微孔滤器过滤除去杂质、细胞碎片后分装冻存,培养单细胞突变子时在新鲜F12完全培养基中加入45-55%的上述培养基即为条件培养基;所述流式细胞缓冲液采用的配方为:质量比为1%的牛血清白蛋白,10mM叠氮钠溶解于磷酸盐缓冲液PBS,pH=7.0。
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