[发明专利]一种碱基编辑系统及其构建和应用方法有效
申请号: | 201710239348.X | 申请日: | 2017-04-13 |
公开(公告)号: | CN106916852B | 公开(公告)日: | 2020-12-04 |
发明(设计)人: | 陈佳;杨力;杨贝;薛尉;王丽洁 | 申请(专利权)人: | 上海科技大学 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N15/113 |
代理公司: | 上海申汇专利代理有限公司 31001 | 代理人: | 翁若莹;王婧 |
地址: | 200120 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 碱基 编辑 系统 及其 构建 应用 方法 | ||
1.一种碱基编辑系统,其特征在于,包括尿嘧啶糖苷酶抑制剂(uracil glycosylaseinhibitor,UGI)表达载体或其转录产物和碱基编辑器3(base editor 3,BE3)表达载体或其转录产物,或包括尿嘧啶糖苷酶抑制剂(uracil glycosylase inhibitor,UGI)和碱基编辑器3(base editor 3,BE3)共表达载体或其转录产物,所述共表达载体利用T2A自剪切肽段在BE3编码区下游同框接入UGI基因;以及还包括针对某物种的基因组靶点的sgRNA表达载体。
2.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,所述的UGI和BE3共表达载体为增强型CRISPR碱基编辑器eBEa表达载体,其序列为SEQ ID NO:22。
3.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,所述的UGI和BE3共表达载体为增强型CRISPR碱基编辑器eBEb表达载体,其序列为SEQ ID NO:23。
4.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,所述的UGI表达载体的序列包括SEQID NO:20。
5.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,所述的碱基编辑系统还包括真核细胞和基因转导试剂。
6.权利要求1-5中任一项所述的碱基编辑系统的构建方法,其特征在于,包括扩增UGI基因,并连入真核表达载体中,得到UGI表达载体;或利用PCR方法扩增T2A-UGI编码序列,并同框连入BE3编码区的下游,得到增强型CRISPR碱基编辑器eBEa表达载体;或人工合成3×T2A-UGI编码序列,PCR扩增后同框连入BE3编码区的下游,得到增强型CRISPR碱基编辑器eBEb表达载体。
7.权利要求1-5中任一项碱基编辑系统的应用方法,其特征在于,包括构建针对某物种的基因组DNA靶点的sgRNA;在真核细胞中共引入sgRNA,BE3表达载体或其转录产物以及UGI表达载体或其转录产物,或者,在真核细胞中共引入sgRNA以及UGI和BE3共表达载体或其转录产物,使其在靶点基因组DNA发生C-T碱基编辑。
8.如权利要求7所述的碱基编辑系统的应用方法,其特征在于,还包括:对处理后的真核细胞基因组DNA进行抽提,然后利用针对靶点的特异性引物进行PCR扩增,利用基因组DNA的PCR产物构建高通量二代DNA测序文库,并进行高通量二代DNA测序。
9.如权利要求7所述的碱基编辑系统的应用方法,其特征在于,所述的某物种的基因组DNA靶点为人的FANCF或RNF2靶点。
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