[发明专利]鉴定Pirangoclytustriangularis的特异性引物和方法及应用在审
申请号: | 201710255073.9 | 申请日: | 2017-04-17 |
公开(公告)号: | CN106868195A | 公开(公告)日: | 2017-06-20 |
发明(设计)人: | 李凯兵;袁淑珍;吴志毅;李海林;刘海军;张永宏;谈珺;马骏;胡学难;梁继海 | 申请(专利权)人: | 李凯兵 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙)11371 | 代理人: | 李进 |
地址: | 528200 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 pirangoclytustriangularis 特异性 引物 方法 应用 | ||
1.一种鉴定Pirangoclytus triangularis的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物的上下游核苷酸序列分别为:
COI-F:5'-ATCTTGTATTTGGTGCCTGAG-3'(SEQ ID NO.1);
COI-R:5'-AGTCGGAGTACCGTCGTG-3'(SEQ ID NO.2)。
2.权利要求1所述的特异性引物在Pirangoclytus triangularis线粒体COI基因序列扩增中的应用。
3.一种Pirangoclytus triangularis的鉴定方法,其特征在于,以Pirangoclytus triangularis样本为基础构建标准流生物分子系统树,以待测样本为基础构建检测流生物分子系统树,分析和比较所述标准流生物分子系统树与所述检测流生物分子系统树,鉴定所述待测样本是否为Pirangoclytus triangularis。
4.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,所述构建标准流生物分子系统树和构建检测流生物分子系统树的方法为NJ法。
5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述NJ法构建标准流生物分子系统树的方法为:以Pirangoclytus triangularis总DNA为模板,利用权利要求1所述的特异性引物进行PCR,并对PCR产物进行测序,获得Pirangoclytus triangularis的线粒体COI核苷酸序列片段,基于所述Pirangoclytustriangularis的线粒体COI基因核苷酸序列片段和相关近缘物种的线粒体COI基因核苷酸序列片段,利用计算机软件,构建标准流生物系统树。
6.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于,所述NJ法构建检测流生物分子系统树的方法为:以待测样本总DNA为模板,利用权利要求1所述的特异性引物进行PCR,并对PCR产物进行测序,获得待测样本的线粒体COI核苷酸序列片段,基于所述待测样本的线粒体COI基因核苷酸序列片段和相关近缘物种的线粒体COI基因核苷酸序列片段,利用计算机软件,构建检测流生物系统树。
7.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,所述分析和比较所述标准流生物分子系统树与所述检测流生物分子系统树为:若所述待测样本与所述Pirangoclytus triangularis形成一个单系群,则判断为Pirangoclytus triangularis;若所述待测样本与所述相关近缘物种形成一个单系群,则判断为相关近缘物种。
8.根据权利要求5所述的鉴定方法,其特征在于,所述Pirangoclytus triangularis的线粒体COI核苷酸序列片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
9.根据权利要求5或6所述的鉴定方法,其特征在于,所述相关近缘物种为Pirangoclytus amaryllis,Pirangoclytus chaparensis,Pirangoclytus flavius,Pirangoclytus fraternus,Pirangoclytus granulipennis,Pirangoclytus insignis,Pirangoclytus jauffreti,Pirangoclytus laetus,Pirangoclytus latecinctus,Pirangoclytus mendosus,Pirangoclytus mniszechii,Pirangoclytus nubicollis,Pirangoclytus placens,Pirangoclytus purus,Pirangoclytus rubefactus,Pirangoclytus sulphurosus,Pirangoclytus triangularis 和Pirangoclytus ycoca。
10.权利要求3所述的Pirangoclytus triangularis的鉴定方法在鉴定Pirangoclytus triangularis物种中的应用。
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