[发明专利]水稻地方品种薄稻穗瘟抗性基因的分子标记引物及其应用

说明书

本发明属于作物分子遗传育种学领域，公开了水稻地方品种薄稻穗瘟抗性基因的分子标记引物及其应用。本发明所述的水稻薄稻穗瘟抗性基因Pb‑bd1的分子标记，所述的分子标记BS23的上游引物为BS23‑F：SEQ ID NO.1，下游引物为BS23‑R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为114bp；所述的分子标记RM7654的上游引物为RM7654‑F：SEQ ID NO.3，下游引物为RM7654‑R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为155bp。通过本发明提供的水稻穗瘟抗性基因Pb‑bd1的分子标记可以检测水稻薄稻及其杂交、回交和复交后代是否含有该基因，可预测其对稻瘟病的抗性水平，大大提高水稻抗穗瘟材料的选择效率，加快抗病育种进程。

技术领域

本发明属于农作物分子遗传育种学领域，涉及水稻地方品种薄稻穗瘟抗性基因的分子标记引物及其应用。

背景技术

水稻是我国最重要的粮食作物之一，对保障我国粮食安全和国民经济增长具有重要意义。稻瘟病是我国水稻生产上最严重的病害，具有传播快、发生广、危害重等特点(凌忠专等，1989，我国北方稻区稻瘟病菌生理小种研究.中国农业科学，22(3):7-13)。进一步发掘和利用我国抗稻瘟病基因资源，培育和种植抗病品种是控制稻瘟病发生和减少水稻产量损失最经济有效的途径。

迄今，各国科学家从水稻中鉴定了100多个抗稻瘟病基因，其中有24个抗病基因被成功克隆。这些抗病基因可以引入或聚合到现代品种，选育出高抗、广谱的品种。但传统育种方法费时、费力、表型鉴定困难、育种效率低，由于抗病基因多为显性、基因间往往存在上位性互作，抗病基因聚合更为困难。通过分子标记辅助育种可以有效解决这一问题。

我国太湖流域稻作历史悠久，被认为是粳稻起源地之一，蕴藏有丰富的稻种资源，李培富等(2007，4个太湖流域粳稻地方品种抗稻瘟病性的遗传分析，遗传，2007年10期)报道我国太湖流域粳稻地方品种薄稻对苗瘟的抗性表现广谱和高抗的特点。在我们的研究中，其对穗瘟也表现出极高的抗性。从我国特有的种质资源中鉴定和克隆穗瘟抗性基因，可以获得具有自主知识产权的基因，对提高我国水稻抗稻瘟病育种水平，尤其是粳稻的抗稻瘟病育种有重大意义。

发明内容

本发明的目的是：提供水稻品种薄稻穗瘟抗性基因Pb-bd1的分子标记方法。通过检测与抗病基因Pb-bd1紧密连锁的分子标记，可以确定有无抗病基因Pb-bd1，并预测水稻植株的稻瘟病抗性，加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进度。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

水稻薄稻穗瘟抗性基因Pb-bd1的分子标记，所述的分子标记选自BS23、RM7654中的任意一种；所述的分子标记BS23的上游引物为BS23-F：SEQ ID NO.1，下游引物为 BS23-R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为114bp；所述的分子标记RM7654的上游引物为 RM7654-F：SEQ ID NO.3，下游引物为RM7654-R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为155bp。

本发明所述的水稻薄稻穗瘟抗性基因Pb-bd1的分子标记引物，所述的分子标记BS23的上游引物为BS23-F：SEQ ID NO.1，下游引物为BS23-R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为 114bp；所述的分子标记RM7654的上游引物为RM7654-F：SEQ ID NO.3，下游引物为RM7654-R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为155bp。

本发明所述的分子标记在鉴别水稻穗瘟抗性基因Pb-bd1中的应用。

本发明所述的分子标记引物在鉴别水稻穗瘟抗性基因Pb-bd1中的应用。

本发明所述的分子标记引物在鉴别抗稻瘟病水稻中的应用。

一种快速鉴别水稻穗瘟抗性基因Pb-bd1存在与否的方法，包含如下步骤：

(1)取水稻样品，提取水稻样品基因组DNA；