[发明专利]前列腺癌诊断用基因组及其应用

权利要求书

1.一种前列腺癌诊断用基因组，其特征在于该基因组为AR、HOXC6和NKX2-2基因。

2.一种前列腺癌的检测方法，采用根据权利要求1所述的前列腺癌诊断用基因，其特征在于该方法的具体步骤为：

a. 选取前列腺癌样本株组成3套数据；

b. 采用SIMBA算法寻找步骤a所得前列腺癌样本株中的互斥转录因子；

c. 采用费舍尔精确检验推测转录因子和其配对基因的调节关系；

d. 利用最小描述方法，即两个基因相关性最小情况，推测转录因子和相关的miRNAs的调节网络；

e. 通过qRT-PCR检测AR、HOXC6、NKX2-2的过表达。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于所述的步骤b的具体步骤为：在R中调取SIMBA程序包，对前列腺癌基因表达数据进行计算获得互斥转录因子。

4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于所述的步骤c的具体步骤为：在R中调用SIMBA程序包中的函数init_network对上述找到的互斥转录因子搜寻靶标并建立初步网络。

5.根据权利要求2所述的方法，其特征在于所述的步骤d的具体步骤为：在R中调用SIMBA程序包中的函数filt_network 对上一步构建的网络进行优化，获得最优化的mRNA-miRNA网络。

6.根据权利要求2所述的方法，其特征在于所述的步骤e的具体步骤为：提取前列腺癌细胞株TotalRNA, 按照试剂盒方法反转录后做qRT-PCR实验检测AR、HOXC6、NKX2-2的表达。

7.一种根据权利要求1所述的前列腺癌诊断用基因组在制备筛选和诊断前列腺癌药物中的应用。

8.一种根据权利要求1所述的前列腺癌诊断用基因组在制备筛选和诊断前列腺癌试剂盒中的应用。