[发明专利]检测HIV-1 2-LTR DNA的PCR引物组、探针及其试剂盒和检测方法有效
申请号: | 201710324569.7 | 申请日: | 2017-05-09 |
公开(公告)号: | CN107119148B | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
发明(设计)人: | 王法;张晓玮;彭春梅;邓可基;乐小炎;张嘉;李家导;陈观芝;林敏深;林若琳;石壮壮;罗园香;莫静嫣;李海茵;张新;王星;吴彩虹 | 申请(专利权)人: | 广州海力特生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 | 代理人: | 刘晔 |
地址: | 510535 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 hiv ltr dna pcr 引物 探针 及其 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测人类免疫缺陷病毒1型2-LTR DNA的检测引物组和检测探针,其特征在于:所述的检测引物组由以下6条引物序列或以下6条引物序列的互补序列组成:
所述的检测引物组由以下6条引物序列:引物1:其序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;引物2:其序列为SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;引物3:其序列为SEQ ID NO:3所示的核苷 酸序列;引物4:其序列为SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列;引物5:其序列为SEQ IDNO:5所 示的核苷酸序列;引物6:其序列为SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列;
所述的检测探针包括探针1和探针2;
所述的探针1的序列为SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列,探针1的核苷酸序列的5’端标记有FAM荧光基团,探针1的核苷酸序列的3’端标记有TAMRA淬灭基团;所述的探针2的序列为SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,探针2的核苷酸序列的5’端标记有FAM荧光基团,探针2的核苷酸序列的3’端标记有淬灭基团TAMRA。
2.如权利要求1所述的检测引物组和检测探针,其特征在于:所述的检测引物组和检测探针用于实时荧光定量PCR技术,实现对HIV-1 2-LTRDNA的检测。
3.一种用于检测人类免疫缺陷病毒1型2-LTR DNA的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒包括权利要求1所述的检测引物组和检测探针。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒还包括:细胞定量引物组和细胞定量探针;
所述的细胞定量引物组由以下4条引物序列或以下4条引物序列的互补序列组成:引物7:其序列为SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列;引物8:其序列为SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列;引物9:其序列为SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列;引物10:其序列为SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列;所述的细胞定量探针的序列为SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列;细胞定量探针的核苷酸序列的5’端标记有荧光基团,所述的荧光基团选自FAM、HEX、VIC、CY5和TET中的一种,细胞定量探针的荧光基团应当不同于检测探针的荧光基团;细胞定量探针的核苷酸序列的3’端标记有淬灭基团,所述的淬灭基团选自TAMRA、MGB和BHQ中的一种;所述的细胞定量探针的荧光基团应当不同于检测探针的荧光基团。
5.如权利要求3-4任意一项所述的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒还包括酶系和PCR反应试剂;
所述的酶系为等体积混合的Taq DNA聚合酶与尿嘧啶-N-糖基化酶;
所述的PCR反应试剂包括:①pH 8.5的Tris-硫酸,储存浓度为1M;②柠檬酸钠,储存浓度为100mM;③(NH4)2SO4,储存浓度为1M;④MgSO4,储存浓度为1M;⑤十二烷基聚乙二醇醚Brij-35,储存浓度为3%;⑥乙酰化牛血清白蛋白,储存浓度为30mg/mL;⑦dNTP,储存浓度为10mM。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒还包括:强阳性质控品、弱阳性质控品、阴性对照品和阳性定量参考品。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于:
所述的强阳性质控品为含有HIV-1 2-LTR DNA序列的质粒,且其中HIV-1 2-LTR DNA基因的浓度为0.05~0.5拷贝/每个细胞;所述的弱阳性质控品为含有HIV-1 2-LTR DNA序列的质粒,且其中HIV-1 2-LTR DNA基因的浓度为0.0005~0.005拷贝/每个细胞;所述的阴性对照品为生理盐水;所述的阳性定量参照品为已知浓度的携带HIV-1 2-LTR DNA序列的质粒或携带该质粒的细胞。
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