[发明专利]获得与低分子含氮有机化合物特异性结合的适配体的方法

说明书

本发明的课题是提供通过电泳法从DNA文库获得与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体的方法。本发明的解决课题的方法是与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体的获得方法，该方法具备以下工序：工序(a)，制备含有所述低分子含氮有机化合物和DNA文库的水溶液，工序(b)，通过使用电渗流抑制毛细管的电泳将所述水溶液分级，得到含有复合物的级分，所述复合物包含所述DNA文库所含的单链DNA和所述低分子含氮有机化合物，和工序(c)，通过PCR法扩增所述复合物所含的单链DNA，将所述扩增而得的单链DNA作为所述与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体获得。

技术领域

本发明涉及通过电泳法获得与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体的方法。

背景技术

适配体(aptamer)是指能够与规定的分子特异性地结合的核酸分子。非专利文献1公开了用5’-HS-(CH₂)₁₁-AGACAAGGAAAATCCTTCAATGAAGTGGGTCG-(CH₂)₇-MB-3’(序列号：04，“MB”表示亚甲蓝)表示的适配体。非专利文献1所公开的适配体与可卡因特异性地结合。

专利文献1公开了单碱基突变体的检测方法。

现有技术文献

专利文献

专利文献1：日本特开2009-038983号公报

非专利文献

非专利文献1：James S.Swensen et al,“Continuous,Real-Time Monitoring ofcocaine in Undiluted Blood Serum via a Microfluidic,Electrochemical Aptamer-Based Sensor”Journal of American Chemical Society,2009,131,4262-4266

非专利文献2：Hidenobu Yaku et.,al.,“Anionic phthalocyanines targetingG-quadruplexes and inhibiting telomerase activity in the presence ofexcessive DNA duplexes”,Chem.Commun.,2010,Vol.46,pp.5740–5742

非专利文献3：Richard T.Wheelhouse et.al.“Cationic Porphyrins asTelomerase Inhibitors:the Interaction of Tetra-(N-methyl-4-pyridyl)porphinewith Quadruplex DNA”,Journal of the American Chemical Society,1998,120,3261–3262

发明内容

发明所要解决的课题

本发明的目的是提供通过电泳法从DNA文库获得与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体的方法。

用于解决课题的方法

本发明是获得与低分子含氮有机化合物特异性地结合的适配体的方法，该方法具备以下工序：

工序(a)，制备含有所述低分子含氮有机化合物和DNA文库的水溶液，

工序(b)，通过使用电渗流抑制毛细管的电泳将所述水溶液分级，得到含有复合物的级分，所述复合物包含所述DNA文库所含的单链DNA和所述低分子含氮有机化合物，

工序(c)，通过PCR法扩增所述复合物所含的单链DNA，结合的适配体获得。

发明的效果