[发明专利]用于高通量聚糖分析的装置、方法、计算机程序产品和试剂盒在审
申请号: | 201710431702.9 | 申请日: | 2012-08-10 |
公开(公告)号: | CN107422020A | 公开(公告)日: | 2017-12-01 |
发明(设计)人: | P.斯莱德 | 申请(专利权)人: | 生命科技公司 |
主分类号: | G01N27/447 | 分类号: | G01N27/447;G01N33/68;G01N33/58;G01N33/577 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司72001 | 代理人: | 杨思捷 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 通量 聚糖 分析 装置 方法 计算机 程序 产品 试剂盒 | ||
1.用于高通量聚糖分析的方法,包括:
将多个糖蛋白样品加入多个上样孔中;
使用变性溶液变性上样孔中的糖蛋白样品;
使用聚糖裂解酶从上样孔中的每个变性糖蛋白样品上裂解聚糖;
用带电的荧光标签标记所裂解的聚糖;
施用配置为使标记聚糖从上样孔穿过离子渗透膜进入并沿着与上样孔对应排列的多个毛细管中的一个迁移的电场,每个毛细管包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分;
用适合导致标记聚糖发射荧光辐射的光源激发沿着毛细管迁移的标记聚糖;
检测由标记聚糖所发射的荧光辐射;和
基于所检测的荧光辐射分析标记聚糖。
2.权利要求1的方法,其中变性上样孔中的糖蛋白样品包括使用SDS变性糖蛋白样品。
3.权利要求1的方法,还包括将每个糖蛋白样品与TBE缓冲溶液混合。
4.权利要求1的方法,其中从每个变性糖蛋白样品裂解聚糖包括使用PNGase F裂解聚糖。
5.权利要求1的方法,其中从每个变性糖蛋白样品裂解聚糖包括使用内切糖苷酶H裂解聚糖。
6.权利要求1的方法,其中从每个变性糖蛋白样品裂解聚糖包括使用Endo D、Endo Fl、Endo F2和Endo F3中的一种或多种裂解聚糖。
7.权利要求1的方法,其中从每个变性糖蛋白样品裂解聚糖包括使用ABS (产脲节杆菌唾液酸酶)、NAN 1 (重组唾液酸酶)、AMF (杏仁粉α-岩藻糖苷酶)、BKF (牛肾α-岩藻糖苷酶)、BTG (牛睾丸β-半乳糖苷酶)、SPG (肺炎链球菌β-半乳糖苷酶)、GUH (肺炎链球菌己糖胺酶,大肠杆菌重组体)和JBM (刀豆甘露糖苷酶)中的一种或多种裂解聚糖。
8.权利要求1的方法,其中从每个变性糖蛋白样品裂解聚糖包括使用肽-N-(N-乙酰基-β-葡萄糖胺基)天冬酰胺酰胺酶裂解聚糖。
9.权利要求1的方法,其中使用肽-N-(N-乙酰基-β-葡萄糖胺基)天冬酰胺酰胺酶裂解聚糖包括裂解N-连接聚糖。
10.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用8-氨基萘-1,3,6-三磺酸二钠在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
11.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用7-氨基-1,3-萘二磺酸钾在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
12.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用4-氨基-萘磺酸钠在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
13.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用包含酰肼官能团的带电荧光标签在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
14.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用包含ALEXA FLUOR 350酰肼、ALEXA FLUOR 488酰肼、ALEXA FLUOR 647酰肼、ALEXA FLUOR 594酰肼和ALEXA FLUOR 555酰肼中的一种或多种的带电荧光标签在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
15.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用包含ALEXA FLUOR 350羟胺、ALEXA FLUOR 488羟胺和ALEXA FLUOR 647羟胺中的一种或多种所包括的羟胺官能团的带电荧光标签在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
16.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用包含8-酰肼-芘-3,6,8-三磺酸盐中所包括的酰肼官能团的带电荧光标签在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
17.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括用包含8-羟胺-芘-3,6,8-三磺酸盐中所包括的羟胺官能团的带电荧光标签在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
18.权利要求1的方法,其中用带电荧光标签标记所裂解的聚糖包括使用APTS、ANTS、ANDA和ANSA中的一种或多种在聚糖的还原末端标记所裂解的聚糖。
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