[发明专利]用于高通量聚糖分析的装置、方法、计算机程序产品和试剂盒

说明书

本申请是申请号为201280050173.3母案的分案申请。该母案的申请日为2012年8月10日；发明名称为“用于高通量聚糖分析的装置、方法、计算机程序产品和试剂盒”。

背景

1. 技术领域

本申请主要涉及用于高通量聚糖分析的装置、方法和计算机程序产品。

2. 背景技术

与蛋白质表面相连的碳水化合物或聚糖在确保正确的细胞和蛋白功能以及介导蛋白折叠、信号传导和其它重要细胞系统中发挥重要作用。然而，聚糖分析是富有挑战性的，涉及耗时的样品制备和复杂的低通量分析技术。存在对有效和简单允许实施聚糖高通量分析同时保持足够的分辨率和灵敏度的新的和改进的装置、方法和计算机程序产品的需求。这样的需求特别适用于多个领域，包括例如其中需要快速有效分析大量聚糖的学术研究和工业研究以及生物生产和制药工业。

发明内容

提供用于高通量聚糖分析的装置、系统、方法和计算机程序产品。

在一个方面，提供用于聚糖分析的装置。所述装置包括：(1)适合接收多个样品的多个上样孔；(2)与上样孔对应排列的多个毛细管，每个毛细管包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分；和(3)与毛细管对应排列且适合接收已穿过毛细管的样品部分的多个洗脱孔。

在一个方面，提供用于聚糖分析的毛细管阵列。该毛细管阵列包括：(1)至少五个基本上相互平行排列的毛细管，每个毛细管包括排列在毛细管第一部分的预灌注成层胶和排列在毛细管第二部分的预灌注分离胶，和(2)排列在至少五个毛细管的对侧使得该至少五个毛细管形成单一单元的第一和第二支撑结构。

在一个方面，提供了存储在计算机可读媒体中的信息元素文库。所述信息文库包括：(1)当毛细管经受电场时迁移穿过毛细管(包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分)的多个单个带电、荧光标记聚糖所对应的多个由实验得出的毛细管迁移时间；和(2)葡聚糖阶梯所对应的迁移时间。

在一个方面，提供用于高通量聚糖分析的方法。所述方法包括：(1)将多个糖蛋白样品加入多个上样孔中；(2)使用变性溶液变性上样孔中的糖蛋白样品；(3)使用聚糖裂解酶从上样孔中的每个变性糖蛋白样品上裂解聚糖；(4)用带电荧光标签标记所裂解的聚糖；和(5)施用电场，该电场配置为使标记聚糖从上样孔穿过离子渗透膜并进入且沿着与上样孔对应排列的多个毛细管中的一个迁移，每个毛细管包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分；(6)用适合导致标记聚糖发射荧光辐射的光源激发沿着毛细管迁移的标记聚糖；(7)检测标记聚糖所发射的荧光辐射；和(8)基于所检测的荧光辐射分析标记聚糖。

在一个方面，提供制造用于高通量聚糖分析的毛细管阵列的方法。所述方法包括：(1)提供多个毛细管；(2)向每个毛细管中预灌注第一部分的成层胶和第二部分的分离胶；和(3)在对侧将毛细管结构性连接，使得毛细管基本上相互平行排列并形成单一单元。

在一个方面，提供用于产生聚糖数据库的方法。所述方法包括：(1)通过实验获得当毛细管经受电场时已迁移穿过毛细管(包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分)的多个单个带电、荧光标记聚糖所对应的多个由实验得出的迁移时间；和(2)将所收集的与已迁移穿过毛细管的多个单个带电、荧光标记聚糖中的每一个的识别信息相对应的多个由实验得出的迁移时间排列进入配置为计算机可访问的数据库。

在一个方面，提供用于鉴定多个聚糖的方法。所述方法包括：(1)用带电荧光标签标记聚糖；(2)使标记聚糖沿着多个毛细管(沿基本平行的方向进入电场)迁移，每个毛细管包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分；(3)基于检测的标记聚糖所发射的荧光辐射，确定每种标记聚糖相对于荧光标记葡糖糖标准阶梯的迁移时间；和(4)比较相对迁移时间与当毛细管经受电场时已迁移穿过毛细管(包括包含成层胶的第一部分和包含分离胶的第二部分)的多个单个带电、荧光标记聚糖所对应的由实验得出的迁移时间的数据库。