[发明专利]Taqman-MGB探针检测绵羊BMPR-IB基因A746G突变的试剂盒和方法有效
申请号: | 201710444692.2 | 申请日: | 2017-06-13 |
公开(公告)号: | CN107338287B | 公开(公告)日: | 2021-06-15 |
发明(设计)人: | 杨华;杨永林;李良远;卢守亮;杨涵羽璐 | 申请(专利权)人: | 新疆农垦科学院 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 赵徐平 |
地址: | 832000 新疆维吾尔自治*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | taqman mgb 探针 检测 绵羊 bmpr ib 基因 a746g 突变 试剂盒 方法 | ||
1.检测绵羊BMPR-IB基因A746G突变的试剂盒,其特征在于该试剂盒包含阳性对照、DNA提取液Ⅰ、DNA提取液Ⅱ、2×LightCycler 480 probes master、一对引物BMF和BMR,以及其对应的探针BPA和BPG、ddH2O;
其中DNA提取液Ⅰ、DNA提取液Ⅱ,其组成成分如下:
DNA提取液Ⅰ:0.01mol/L Tris,0.01mol/L NaCL,0.005~0.01mol/L MgCl2﹒6H2O;
DNA提取液Ⅱ:10mmol/L Tris,0.1mmol/L EDTA-Na2﹒2H2O,0.1~1%TritonX-100;
其上游引物BMF的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;
其下游引物BMR的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:2所示;
其野生探针BPA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:3所示;
其突变探针BPG的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:4所示;
所述野生探针BPA的5’一端标记有荧光基团1,3'一端标记有MGB淬灭基团;所述突变探针BPG的5’一端标记有荧光基团2,3'一端标记有MGB淬灭基团;
其中所述的荧光基团1或荧光基团2为FAM、TET、VIC、HEX或ROX中的一种,且荧光基团1与荧光基团2不相同。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于该试剂盒中所包含的阳性对照样品为三个,分别对应绵羊BMPR-IB基因的++、B+和BB三种基因型。
3.一种利用权利要求2所述试剂盒的检测方法,包括以下步骤:
(1)从绵羊血液中提取基因组DNA:
(a)取无菌的1.5ml离心管,向其中加入混匀的EDTA抗凝血200μl和DNA提取液Ⅰ溶液600μl,充分混匀,室温静置10min;将离心管置于离心机中,6000rpm离心1min;
(b)取出离心管,倾去上清液,保留沉淀;向离心管中加入DNA提取液Ⅱ溶液60μl,充分振荡混匀;沸水浴中10min;
(c)取出离心管,置离心机中,12,000rpm离心10min,离心后上清液可用于后续实验;
(2)将步骤(1)得到的DNA加入到PCR反应液中,取所述引物和探针,进行实时荧光定量PCR扩增,获得绵羊的BMPR-IB基因包含A746G突变位点的基因片段;
(3)根据检测到的荧光信号对绵羊BMPR-IB基因A746G位点的三种基因型进行判定,即++、B+和BB基因型。
4.如权利要求3所述的检测方法,其特征在于:步骤(2)中实时荧光定量PCR反应所使用的扩增体系为20μL,扩增体系中包含以下溶液或试剂:2×LightCycler 480 probesmaster 10μL,10μmol/L上游引物BMF 0.8μL,10μmol/L下游引物BMR 0.8μL,10μmol/L野生探针BPA0.4μL,10μmol/L突变探针BPG0.4μL,基因组DNA3μL,去离子水补齐至20μL。
5.如权利要求3或4所述的检测方法,其特征在于:步骤(2)中实时荧光定量PCR反应所使用的扩增程序为95℃预变性10min;95℃变性10sec,55℃退火30sec,72℃延伸1sec,45个循环。
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