[发明专利]一种化学修饰UNG酶及其修饰方法和应用有效
申请号: | 201710491119.7 | 申请日: | 2017-06-23 |
公开(公告)号: | CN107312762B | 公开(公告)日: | 2020-08-11 |
发明(设计)人: | 胡振新;谭卓;郜安国 | 申请(专利权)人: | 苏州点晶生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/24 | 分类号: | C12N9/24;C12N15/10;C12P19/34 |
代理公司: | 苏州华博知识产权代理有限公司 32232 | 代理人: | 何蔚 |
地址: | 215123 江苏省苏州市苏州工业园*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 化学 修饰 ung 及其 方法 应用 | ||
本发明公开了一种化学修饰UNG酶,所述化学修饰UNG酶是由酸酐修饰的UNG酶。所述化学修饰UNG酶能在某一温度或以下不表现酶活性,而在特定温度下孵育一段时间后去修饰可以恢复正常活性,从而实现活性可控。本发明还提供一种用酸酐修饰UNG酶的方法、以及所述化学修饰UNG酶的应用。本发明的用酸酐修饰UNG酶的方法,可以制备的化学修饰UNG酶。所述化学修饰UNG酶用于EMA(多酶介导的核酸常温扩增)或其它核酸等温扩增方法中,可防止扩增产物污染反应体系和环境,耗时短,操作简单,活性可控。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种化学修饰UNG酶及其修饰方法、在核酸扩增中的应用。
背景技术
PCR是一种极灵敏的扩增技术,易受污染的影响,小量的外源DNA污染就可以与目的模板一起被扩增,从而影响扩增结果和判断。当前一次扩增产物由于误操作(主要是以气溶胶的形式)而进入新的扩增反应时,会发生共同来源的污染,这称之为残余污染;从其他样品中纯化的DNA或克隆的DNA也会是污染源。
由于扩增产物的量大且非常容易以气溶胶的形式扩散,即使实验室严格分区,也难免因为误操作而受到污染。为保证PCR结果的准确性,要预防非特异性PCR扩增和污染。常用的措施是使用UNG酶(Uracil-N-Glycosylase)(也称为UDG,Uracil-DNA Glycocasylase,以下简称为UNG酶)和Taq酶热启动。
UNG酶是克隆有Uracil-N-Glycosylase基因的大肠杆菌经诱导表达后,再经三次过柱纯化分离出来的重组蛋白。UNG酶的作用原理是选择性水解断裂含有dUMP的双链或单链DNA中的尿嘧啶糖苷键,形成的有缺失碱基的DNA链,在碱性介质以及高温下会进一步水解断裂,从而被消除。本发明所用的UNG酶是Thermus aquaticus在大肠杆菌中表达的,最佳活性温度为50-65℃,95℃下10分钟灭活。
UNG酶防污染技术原理是在扩增过程中以脱氧尿苷(dUTP)代替脱氧胸苷(dTTP),或者以一定比例把dUTP加入到dNTP中,从而得到含有dUMP的扩增产物。尿苷酶(UNG)能特异地破坏含有dUMP的DNA产物,使之不能作为扩增模版,但对天然的不含dUMP的核酸不起作用。故只要在扩增反应前加入UNG酶,就可以破坏过往扩增反应残余的含有d-UMP的DNA,但对不含d-UMP的目标DNA不起作用,从而使目标DNA得到扩增。随后将UNG酶高温灭活,再进行扩增。这样就可以有效地防止实验室内扩增产物的残余污染,避免假阳性的出现。
现有技术将UNG酶运用于PCR扩增防污染,在PCR开始前增加30℃~37℃的保温步骤,UNG酶即可将反应体系中已有的dUMP的DNA污染物中的尿嘧啶碱基降解,并在随后变性这一步骤的条件下DNA链断裂,消除由于污染DNA产生的扩增。这个处理对PCR有效,但是却无法用于等温或常温扩增。由于UNG酶在一定温度范围内(30℃-90℃)均有活性,在PCR扩增的时候,dUTP掺入扩增产物过程中,UNG酶会切除该碱基,影响最终扩增效率,因此在普通PCR开始之前,必须有一步热处理使UNG变性而失活。变性的温度要求较高(95℃左右),而等温反应的酶在这样温度下会失活。同时,PCR防污染体系在扩增检测之前,增加了检测的时间,虽然高温下,UNG酶会变性失活,但是也有报道提示残留的UNG酶活性会干扰后续的扩增检测。
恒温扩增的防污染的方法如美国专利(专利号US 8945845 B2)披露的需要开管加入UNG酶,然后加入反应试剂和UNG酶抑制剂,需要开管两次,增加了实验操作步骤和核酸泄漏风险,延长检测时间。
发明内容
针对以上问题,本发明的目的是提供一种化学修饰UNG酶、化学修饰方法以及化学修饰UNG酶的应用。这种化学修饰UNG酶能在低于某一温度下不表现酶活性,而在该温度以上孵育一段时间后去修饰就可以恢复正常活性,从而实现活性可控。该化学修饰UNG酶应用于常温或等温扩增中,可建立核酸常温或等温扩增的防污染体系,耗时短,操作简单,有效清除残余污染。
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