[发明专利]基于微卫星标记Scabrou_B的魁蚶基因型检测引物和方法在审

专利信息
申请号: 201710503891.6 申请日: 2017-06-28
公开(公告)号: CN107419010A 公开(公告)日: 2017-12-01
发明(设计)人: 刘云国;李瑶瑶;刘凌霄;李彦伸;高永林;李倩;姜竹茂 申请(专利权)人: 烟台大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 264005 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 基于 卫星 标记 scabrou_b 基因型 检测 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种魁蚶微卫星标记Scabrou_B的基因型检测方法,其特征在于,首先提取魁蚶肌肉中的基因组DNA并稀释备用;再利用魁蚶DNA序列中含有的微卫星核心序列,使用特异性引物对魁蚶不同个体的基因组DNA进行PCR扩增,对PCR产物进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,从而确定魁蚶不同个体在Scabrou_B核心序列区的基因型。

2.一组魁蚶微卫星标记Scabrou_B的检测引物,其特征在于,所述引物序列为:

正链5’- ATATCACGAATACTGATAATTTG -3’,

负链5’- GAAACTTCACCCATACACAAATT -3’,使用该引物时的退火温度为53℃。

3.如权利要求1所述的魁蚶微卫星标记Scabrou_B的检测方法,其特征在于,对不同魁蚶个体的基因组DNA进行的PCR扩增,其加样参数为:每个PCR反应总体积为25μl,包括100ng魁蚶基因组DNA;10×PCR Buffer,2.5μl;Mg2+ 1.5 mmol/L;Taq酶1u;dNTP 0.1mmol/L;权利要求2中所述的特异性引物各10 pmol;最后加ddH2O至25μl;设置PCR仪的程序参数为:94℃变性2min;94℃ 30sec,53℃ 45sec,72℃ 40sec,该反应进行35个循环;72℃延伸5 min,4℃保存。

4.如权利要求1所述的魁蚶微卫星标记Scabrou_B的检测方法,其特征在于,对PCR产物进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的步骤:将PCR产物在8%的变性聚丙烯酰胺凝胶中以15W恒功率电泳1.5小时进行分离, 以10%的冰醋酸溶液浸泡30min,然后蒸馏水冲洗5min,再以0.1%的硝酸银溶液浸泡30min,用3%的碳酸钠溶液显色 5min,最后用10%的冰醋酸溶液浸泡5min。

5.权利要求1-4所述的方法在魁蚶群体间遗传多态性图谱构建上的应用。

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