[发明专利]用于检测CDKN2B基因变异的试剂盒及CDKN2B基因变异率的定量检测方法有效
申请号: | 201710549265.0 | 申请日: | 2017-07-07 |
公开(公告)号: | CN107164534B | 公开(公告)日: | 2020-06-23 |
发明(设计)人: | 张海鹰;严杰;董文明;金嘉敏 | 申请(专利权)人: | 苏州西山中科药物研究开发有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州谨和知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32295 | 代理人: | 叶栋 |
地址: | 215000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 cdkn2b 基因 变异 试剂盒 定量 方法 | ||
1.一种用于检测CDKN2B基因变异的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒用于CDKN2B基因变异率的定量检测;其中,所述试剂盒包含一对靶基因特异性引物和两条不同荧光标记的探针;
所述一对靶基因特异性引物为突变区引物和保守区引物,所述两条不同荧光标记的探针分别为FAM标记的非突变探针,和vic标记的突变探针;
其中,
①突变区引物和vic标记的突变探针的核苷酸序列分别为:
正向引物:CTTATGCAGTTCCTCACCAAAGTTT;
逆向引物:GGATAGGAAGAGAACCGCAAGTT;
vic标记的突变探针:VIC-AGGCAACAAATCCA-NONE;
②保守区引物和FAM标记的非突变探针为如下产品:
试验代码为 Hs03922281_s1,
登记号: 4426961,
ABI产品。
2.一种权利要求1所述的检测CDKN2B基因变异的试剂盒在制备CDKN2B基因变异率的定量检测产品中的应用,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取CDKN2B基因组DNA作为模板;
(2)向反应体系中加入PCR预混合液:权利要求1所述的一对靶基因特异性引物和两条不同荧光标记的探针和DNA模板进行定量PCR;
(3)检测步骤(2)突变区和非突变区的荧光信号到达设定域值时所经历的循环数,作为CT值;
(4)根据步骤(3)突变区和非突变区CT值计算变异系数,即变异系数(%)= 突变区CT值/非突变区CT值x 100。
3.根据权利要求2所述的应用,其中,步骤(1)DNA的提取采用DNeasy血液和组织试剂盒,按照说明书指引提取血液或组织DNA,鉴定DNA浓度和质量,-20℃存储备用。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,步骤(2)向反应条件为i)、50℃,2 分钟;ii)、95℃,10 分钟;iii)、95℃,15 秒;iv)、59℃ , 1分钟;其中iii)和iv)进行 45个循环。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述的PCR预混合液为2 x Master mix。
6.根据权利要求2所述的应用,包括以下步骤:
(1)提取CDKN2B基因组DNA,用DNeasy血液和组织试剂盒,按照说明书指引提取血液或组织DNA;
(2)定量PCR:
反应体系:
PCR预混合液选用2 x Master mix: 20ul
引物-M F 50nM: 0.5ul
引物-M R 50nM: 0.5ul
探针-MP 250nM: 0.5ul
Hs03922281_s1: 1.0ul
模板 DNA 10-20ng/ml: 10ul
水: 7.5ul
总反应体积=40ul
反应条件为:i)、50℃,2 分钟;ii)、95℃,10 分钟;iii)、95℃,15 秒;iv)、59℃ , 1分钟;其中iii)和iv)进行 45个循环;
(3)检测结果:变异系数(%)= 突变CT值/非突变CT值x100。
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