[发明专利]一种旱稻孢囊线虫LAMP快速检测方法在审
申请号: | 201710554029.8 | 申请日: | 2017-07-09 |
公开(公告)号: | CN107142329A | 公开(公告)日: | 2017-09-08 |
发明(设计)人: | 彭焕;彭德良;巧巧·吴泰;黄文坤;孔令安;贺文婷;丁中 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙)11333 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 旱稻 孢囊 线虫 lamp 快速 检测 方法 | ||
1.一种旱稻孢囊线虫LAMP快速检测方法,其特征在于:其中LAMP反应体系所使用的引物是:
1)HE-F3:5’-GCTCTCTGTCCATGTCAGGA-3’,
2)HE-B3:5’-CCGCAACTAGCCCAATGC-3’,
3)HE-FIP:5’-GCAGGACAGCTGCCCATGTGGCGGATCGTTCGGGAGAA-3’,
4)HE-BIP:5’-GCGCAGCTTGGGATGCTTTTACCACAGGCTTACACTTGTG-3’,
5)HE-LB:5’-AGGTTGGAGCTGGGATGCG-3’。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其中的LAMP反应体系包括:
(1)引物混合液:外引物HE-F3和HE-B3各0.2μmol/L,内引物HE-FIP和HE-BIP各1.4μmol/L,环引物HE-LB为0.4μmol/L;
(2)反应混合液:3.2mmol/L dNTP,20mmol/L Tris-HCl(pH 8.8),10mmol/L KCl,3mmol/L MgSO4,10mmol/L(NH4)2SO4,0.1%Triton x-100,8U Bst DNA大片段聚合酶;
(3)1μl DNA模板;
加灭菌双蒸馏水补全到25μl。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其中LAMP反应条件如下:将引物混合液和反应混合液混合均匀后加入1μl DNA模板,61~65℃温育30~90min,85℃保温5min。
4.根据权利要求3所述的检测方法,包括LAMP反应后的鉴定步骤,所述鉴定步骤包括显色鉴定或电泳图鉴定。
5.根据权利要求4所述的检测方法,所述显色鉴定为在扩增反应产物中加入的显色剂为100倍SYBR Green I,以肉眼观察显色结果,显绿色荧光的为旱稻孢囊线虫。
6.根据权利要求4所述的检测方法,所述电泳图鉴定为电泳图显示为梯形条带的为旱稻孢囊线虫。
7.根据权利要求4所述的检测方法,所述电泳图鉴定为在扩增反应产物中加入探针,杂交后,插入LFD试纸,发现同时存在测试带和控制带,所述探针的序列为:HE-probe:5’-CGCCGAGGTTGGAGCTGGGATGC-3’。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其中的HE-FIP采用荧光基团标记,5’段采用生物素标记。
9.根据权利要求7所述的检测方法,所述探针5’段采用FITC标记。
10.权利要求1-9所述任一检测方法在旱稻孢囊线虫早期诊断和辅助鉴定中应用。
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