[发明专利]一种用于以实时荧光RT‑PCR检测样品中HIV‑1病毒的引物对和包含其的试剂盒在审
申请号: | 201710587499.4 | 申请日: | 2017-07-18 |
公开(公告)号: | CN107164565A | 公开(公告)日: | 2017-09-15 |
发明(设计)人: | 张梦玲 | 申请(专利权)人: | 张梦玲 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 南昌青远专利代理事务所(普通合伙)36123 | 代理人: | 刘爱芳 |
地址: | 247100 安徽省池*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 实时 荧光 rt pcr 检测 样品 hiv 病毒 引物 包含 试剂盒 | ||
1.一种特异性结合HIV-1病毒的引物对,所述引物对由上游引物和下游引物组成,其特征在于,所述上游引物包含SEQ ID NO. 1所示的核苷酸序列,所述下游引物包含SEQ ID NO. 2所示的核苷酸序列:
SEQ ID NO. 1 GGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAA;
SEQ ID NO. 2 TAAACCCGAAAATTTTGAATT;
优选的,所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示,所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO. 2所示。
2.根据权利要求1所述的引物对,其特征在于,所述上游引物为荧光标记的引物,其中,所述上游引物的3’端标记有荧光报告基团,所述上游引物的5’端标记有荧光淬灭基团;或者所述上游引物的3’端标记有荧光淬灭基团,所述上游引物的5’端标记有荧光报告基团;
优选的,所述荧光报告基团为选自FAM、HEX、Texas Red、TET、JOE、TAMRA、ROX、LC Red610、LC Red640和CY5中的一种或多种;更优选为FAM;
优选的,所述荧光淬灭基团为选自BHQ1、Eclipse、BHQ3、BHQ2、Dabcyl和TAMRA中的一种或多种;更优选为BHQ1。
3. 一种特异性结合HIV-1病毒的引物对,所述引物对由上游引物和下游引物组成,其特征在于,所述上游引物包含SEQ ID NO. 3所示的核苷酸序列,所述下游引物包含SEQ ID NO. 2所示的核苷酸序列:
SEQ ID NO. 3 GACAGCAGTACAAATGGCAG;
优选的,所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO. 3所示,所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO. 2所示。
4.一种用于检测HIV-1病毒的探针,其特征在于,所述探针包含SEQ ID NO. 1所示的核苷酸序列;
优选的,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示;
还优选的,所述探针的3’端标记有荧光报告基团,所述荧光报告基团为选自FAM、HEX、Texas Red、TET、JOE、TAMRA、ROX、LC Red610、LC Red640和CY5中的一种,更优选为FAM;所述探针的5’端标记有荧光淬灭基团,所述荧光淬灭基团为选自BHQ1、Eclipse、BHQ3、BHQ2、Dabcyl和TAMRA中的一种或多种,更优选为BHQ1。
5.根据权利要求1至3中任一项所述的引物对,或者权利要求4所述的探针,其特征在于,所述HIV-1病毒为人源HIV病毒。
6.一种用于以实时荧光定量RT-PCR检测样品中HIV-1病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
(1)权利要求1至3中任一项所述的引物对;
或者,所述试剂盒包括:
(1)权利要求3所述的引物对;
(2)权利要求4所述的探针。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括以下中的一种或多种:
(A)dNTPs;
(B)PCR反应缓冲液;
(C)Mg2+;
(D)高保真DNA聚合酶或Taq酶;优选的,
(E)反转录酶,优选为AMV RTase;
优选的,所述试剂盒还包括以下中的一种或多种:
(F)样品RNA提取试剂;
(G)阴性质控品,为水,优选为DEPC水;和
(H)阳性质控品,为HIV-1病毒RNA片段,优选为1×105拷贝/μl的HIV-1病毒RNA片段。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述高保真DNA聚合酶是具有3’-5’外切酶活性的DNA聚合酶,为选自Pfu DNA聚合酶、PrimeSTAR® HS DNA聚合酶、KOD 酶、Q5TM超保真DNA聚合酶、Phi9DNA聚合酶和Klenow酶中的一种或多种;
优选的,所述样品为选自全血、血浆、淋巴细胞富集液、外周血淋巴细胞和滤纸干血斑中的一种或多种。
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