[发明专利]一种用于猪瘟疫苗效力检验的荧光定量PCR方法在审
申请号: | 201710588797.5 | 申请日: | 2017-07-19 |
公开(公告)号: | CN108950059A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 许秀梅;朱晓玮;王艳 | 申请(专利权)人: | 南京天邦生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 | 代理人: | 高姗 |
地址: | 211000 江苏省南京市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光定量PCR 效力检验 猪瘟疫苗 兔体 生物技术领域 优化反应条件 特异性试验 病毒核酸 人力物力 样品检测 定量PCR 标准品 反应热 实验兔 检出 扩增 制备 合成 敏感 | ||
1.一种用于猪瘟疫苗效力检验的荧光定量PCR方法,其特征在于,
上游引物5'GCTAGAAACAGGCCAACAAC 3'
下游引物5'GAGTAAACTGCCGCACTCAT 3'产物144bp
探针5'CCGCACTCATGATCCCCAT 3',5’标记FAM,3’标记MGB
包括如下步骤:
步骤1:病毒核酸的提取
分别取PPV、PRV、PRRSV、BVDV、CSFV200μL,按生物病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒的说明方法提取总DNA/RNA;
步骤2:c DNA的合成
反转录采用10μL体系,反应管中依次加入5×Buffer、M-MLV反转录酶、RNasin、10mMdNTP、10μM下游引物和病毒RNA至10μL,反应后得到cDNA模板,保存备用;
步骤3:标准品制备
在25μL体系中进行目的DNA片段的PCR扩增,经目的DNA片段回收纯化、连接、转化及重组质粒提取,制备标准品;
步骤4:荧光定量PCR特异性试验
荧光定量PCR使用TAKARA TP800荧光定量PCR仪进行,反应体系为:Premix Ex Taq,上、下游引物,探针,模板和DDH2O;经预变性,进行40个循环,采集荧光信号,进行TaqMan real-time RT-PCR扩增。
2.根据权利要求1所述的一种用于猪瘟疫苗效力检验的荧光定量PCR方法,其特征在于,所述步骤2中,反应管中依次加入:
2μL的5×Buffer;
0.5μL的M-MLV反转录酶;
0.25μL的RNasin;
1μL的10mM dNTP;
0.5μL的10μM下游引物;
再加入病毒RNA至10μL;
在42℃温度条件下,反应1h,或95℃温度条件下,反应10min,得到cDNA模板,放4℃温度条件下保存备用。
3.根据权利要求1所述的一种用于猪瘟疫苗效力检验的荧光定量PCR方法,其特征在于,所述步骤3包括如下步骤:
步骤31:目的DNA片段的PCR扩增
PCR扩增在25μL体系中进行,反应体系中加入:PremixEx Taq;上、下游引物;cDNA产物;DDH2O;进行变性;
步骤32:目的DNA片段回收纯化
制作大孔琼脂糖凝胶,对目的DNA进行琼脂糖凝胶电泳;在紫外灯下迅速切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶块放置在离心管中,用Axygen凝胶回收试剂盒回收目的条带,最后加30μLElution buffer洗脱DNA,保存于-20℃条件下备用;
步骤33:目的DNA片段的连接与转化
将大孔琼脂糖凝胶回收纯化后的PCR产物,采用pMD18-T载体DNA连接试剂盒,反应体系中加入试剂,试剂加完后瞬时离心,混匀,连接过夜,将连接产物加入感受态细胞DH5a中,混匀后,加入LB液体培养基培养,将培养物离心,过滤上清,再将沉淀混匀涂布于LB琼脂平板上培养;
步骤34:含目的DNA片段的重组质粒提取
挑取经PCR鉴定为阳性的菌落,接种到含有Amp的LB液体培养基中,摇动培养过夜,用Axygen制备质粒试剂盒提取质粒,加入含有RNase的TE缓冲液中,水浴,在紫外分光光度计OD260测定质粒的质量浓度,作为定量PCR的标准品,保存,备用。
4.根据权利要求3所述的一种用于猪瘟疫苗效力检验的荧光定量PCR方法,其特征在于,所述步骤31中,反应体系中加入:PremixEx Taq 12.5μL;上、下游引物各0.5μL;cDNA产物1μL;加DDH2O至25μL;反应在95℃条件下变性5min;变性参数如下:在94℃条件下变性40s;在55℃条件下退火30s;在72℃条件下延伸30s;连续进行34个循环,循环结束后,在72℃条件下延伸5min。
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