[发明专利]用于多基因联合检测妇科肿瘤的引物组、试剂盒、文库及应用在审
申请号: | 201710625540.2 | 申请日: | 2017-07-27 |
公开(公告)号: | CN109321654A | 公开(公告)日: | 2019-02-12 |
发明(设计)人: | 张巍;陆国辉 | 申请(专利权)人: | 张巍 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 北京市盈科律师事务所 11344 | 代理人: | 江锦利 |
地址: | 510000 广东省广州市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 引物组 妇科肿瘤 联合检测 多基因 文库 二代测序技术 特异性扩增 测序文库 假阳性率 目标序列 生化检测 致癌基因 多重PCR 低频率 靶向 测序 富集 构建 上机 捕获 应用 检测 | ||
1.一种用于多基因联合检测妇科肿瘤的引物组,其特征在于:包括AKT1基因引物组、APC基因引物组、BRAF基因引物组、CTNNB1基因引物组、EGFR基因引物组、FBXW7基因引物组、KRAS基因引物组、NRAS基因引物组、PIK3CA基因引物组、PPP2R1A基因引物组、PTEN基因引物组、TP53基因引物组、BRCA1基因引物组和BRCA2基因引物组;
所述的AKT1基因引物组包括1对引物,所述的AKT1基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.1~2所示;
所述的APC基因引物组包括5对引物,所述的APC基因引物组的核酸序列如SEQ ID NO.3~12所示;
所述的BRAF基因引物组基因引物组包括1对引物,所述的BRAF基因引物组的核酸序列如SEQ ID NO.13~14所示;
所述的CTNNB1基因引物组基因引物组包括1对引物,所述的CTNNB1基因引物组的核酸序列如SEQ ID NO.15~16所示;
所述的EGFR基因引物组包括4对引物,所述的EGFR基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.17~24所示;
所述的FBXW7基因引物组包括6对引物,所述的FBXW7基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.25~36所示;
所述的KRAS基因引物组包括3对引物,所述的KRAS基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.37~42所示;
所述的NRAS基因引物组包括2对引物,所述的NRAS基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.43~46所示;
所述的PIK3CA基因引物组包括4对引物,所述的PIK3CA基因引物组的核酸序列如SEQID NO.47~54所示;
所述的PPP2R1A基因引物组包括1对引物,所述的PPP2R1A基因引物组的核酸序列如SEQID NO.55~56所示;
所述的PTEN基因引物组包括7对引物,所述的PTEN基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.57~70所示;
所述的TP53基因引物组包括11对引物,所述的TP53基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.71~92所示;
所述的BRCA1基因引物组包括1对引物,所述的BRCA1基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.93~94所示;
所述的BRCA2基因引物组包括1对引物,所述的BRCA2基因引物组的核酸序列如SEQ IDNO.95~96所示。
2.一种用于多基因联合检测妇科肿瘤的试剂盒,其特征在于:包含权利要求1所述的用于多基因联合检测妇科肿瘤的引物组。
3.根据权利要求2所述的用于多基因联合检测妇科肿瘤的试剂盒,其特征在于具体包含如下组分:PCR扩增模块和磁珠纯化模块;
所述的PCR扩增模块包含如下组分:2×KAPA HiFi HotStart ReadyMix、2.5uM pre-LM-PCR Index、2.5uM pre-LM-PCR Oligo PE-1.0和权利要求1所述的用于多基因联合检测妇科肿瘤的引物组;
所述的pre-LM-PCR Index的核酸序列如SEQ ID NO.97所示;
所述的pre-LM-PCR Oligo PE-1.0的核酸序列如SEQ ID NO.98所示;
所述的磁珠纯化模块包含Magnetic beads和ddH2O。
4.根据权利要求3所述的用于多基因联合检测妇科肿瘤的试剂盒,其特征在于:
所述的PCR扩增模块包含如下组分:
5.根据权利要求3所述的用于多基因联合检测妇科肿瘤的试剂盒,其特征在于:
所述的磁珠纯化模块包含如下组分:
Magnetic beads 90μL/样本;
ddH2O 100μL/样本。
6.一种用于多基因联合检测妇科肿瘤的二代测序DNA文库,其特征在于:利用权利要求2~5任一项所述的试剂盒构建得到。
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