[发明专利]快速准确计算蛋白酶与药物分子之间亲和自由能的算法

权利要求书

1.一种快速准确计算蛋白酶与药物分子之间亲和自由能的算法，其特征是：分别计算自由态的配体，受体，以及结合态的受体-配体综合体的标准化学势，它们之间的差值就是标准结合自由能：

在上式中R代表受体，L代表配体，以及RL代表结合态的受体-配体综合体，代表受体的标准化学势，代表配体的标准化学势，代表结合态的受体-配体综合体的标准化学势，ΔG⁰代表标准结合自由能；

公式(1)中的每一项标准化学势是由如下方法计算出：首先找到该类分子的N个最稳态构象，j表示最稳态构象对应的能量井，j＝1…N，然后计算每一个最稳态构象对应的能量井j的构型积分z_j,并由此算出相应的玻尔兹曼因子RT，最后依据下面的公式合并所有的构型积分而得到配体、受体或结合态的受体-配体综合体的标准化学势：

在上式中X＝R,L,或者RL，C⁰是标准浓度，e是自然对数，是单个构象j的标准化学势。