[发明专利]一种用于肿瘤诊断与预后检测的分子标志物及其检测引物和试剂盒有效
申请号: | 201710679293.4 | 申请日: | 2017-08-10 |
公开(公告)号: | CN107475379B | 公开(公告)日: | 2020-06-02 |
发明(设计)人: | 黄家强;林博楠;王晓月;田荣孟;林舒晔 | 申请(专利权)人: | 北京交通大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京正理专利代理有限公司 11257 | 代理人: | 赵晓丹 |
地址: | 100044*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 肿瘤 诊断 预后 检测 分子 标志 及其 引物 试剂盒 | ||
1.一种用于肿瘤诊断与预后检测的分子标志物,其特征在于,所述分子标志物为PRSS3剪接变异体;其中,所述PRSS3剪接变异体为PRSS3-V1、PRSS3-V2、PRSS3-V3和/或PRSS3-V4,其核苷酸序列分别如SEQ ID No.1-4所示。
2.检测权利要求1所述的分子标记物的物质在制备肿瘤诊断与预后检测的制剂中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述物质为检测权利要求1所述的分子标记物的引物或试剂。
4.一种用于检测权利要求1所述的分子标记物的RT-qPCR引物,其特征在于,包括:用于检测PRSS3-V1、PRSS3-V2、PRSS3-V3和PRSS3-V4的通用引物Vc1或Vc2,其中,所述引物Vc1的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示;所述引物Vc2的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示,下游引物的核苷酸序列如SEQID No.9所示。
5.一种用于检测权利要求1所述的分子标记物的RT-qPCR引物,其特征在于,包括:
PRSS3-V1的特异性引物V1,其上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.10所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.14所示;
PRSS3-V2的特异性引物V2,其上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.11所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.14所示;
PRSS3-V3的特异性引物V3,其上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.12所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.14所示;
PRSS3-V4的特异性引物V4,其上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.13所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.14所示。
6.一种用于检测权利要求1所述的分子标记物的RT-qPCR试剂盒,其特征在于,包括权利要求4或权利要求5所述的RT-qPCR引物。
7.根据权利要求6所述的RT-qPCR试剂盒,其特征在于,还包括用于均一化的内参引物、阳性对照模板、阴性对照模板、cDNA合成试剂和PCR反应试剂。
8.根据权利要求7所述的RT-qPCR试剂盒,其特征在于,所述用于均一化的内参引物为以GAPDH为内参的引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.15和SEQ ID No.16所示;
所述阳性对照模板为经测序验证过的PRSS3剪接变异体PCR扩增产物,或测序验证过的PRSS3剪接变异体克隆质粒;
所述阴性对照模板为去离子水。
9.根据权利要求8所述的RT-qPCR试剂盒,其特征在于,所述PRSS3剪接变异体克隆质粒包括PRSS3剪接变异体的共有序列,所述共有序列如SEQ ID No.5所示。
10.一种非诊断目的的检测权利要求1所述的分子标记物的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)利用权利要求4或5所述的RT-qPCR引物或权利要求6所述的RT-qPCR试剂盒对逆转录合成待检测样本cDNA进行qPCR扩增,得到扩增产物;
2)结果判读:对扩增产物进行判读。
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