[发明专利]抗大豆胞囊线虫相关CAPS标记检测方法及引物有效

专利信息
申请号: 201710718017.4 申请日: 2017-08-21
公开(公告)号: CN107299146B 公开(公告)日: 2020-07-14
发明(设计)人: 邱丽娟;李英慧;田宇 申请(专利权)人: 中国农业科学院作物科学研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/02
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅;张立娜
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 抗大 胞囊 线虫 相关 caps 标记 检测 方法 引物
【权利要求书】:

1.用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定大豆胞囊线虫抗性中的应用;

所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位;所述SNP位点处的核苷酸为G或T。

2.用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在制备用于鉴定或辅助鉴定大豆胞囊线虫抗性的产品中的应用;所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位;所述SNP位点处的核苷酸为G或T。

3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述“用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”为引物对A和限制性内切酶AciI或其同裂酶;

所述引物对A为由序列表中序列2和序列3所示的两条单链DNA组成的引物对。

4.含有权利要求3中所述的“用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”的试剂盒在制备用于鉴定或辅助鉴定大豆胞囊线虫抗性的产品中的应用。

5.含有权利要求3中所述的“用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”的试剂盒在鉴定或辅助鉴定大豆胞囊线虫抗性中的应用。

6.一种鉴定或辅助鉴定待测大豆是否抗大豆胞囊线虫的方法,包括如下步骤:检测待测大豆的基因组中如下SNP位点处的核苷酸,以确定所述待测大豆的基因型;根据所述待测大豆的基因型按照如下确定所述待测大豆是否抗大豆胞囊线虫:若所述待测大豆为T:T基因型,则所述待测大豆抗或候选抗大豆胞囊线虫;若所述待测大豆为G:G基因型,则所述待测大豆不抗或候选不抗大豆胞囊线虫;

所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位;所述SNP位点处的核苷酸为G或T;

所述T:T基因型为大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位为T的纯合型;

所述G:G基因型为大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位为G的纯合型。

7.一种鉴定或辅助鉴定待测大豆对大豆胞囊线虫的抗性的强弱的方法,包括如下步骤:检测待测大豆的基因组中如下SNP位点处的核苷酸,以确定所述待测大豆的基因型;根据所述待测大豆的基因型按照如下确定所述待测大豆对大豆胞囊线虫的抗性的强弱:T:T基因型的所述待测大豆对大豆胞囊线虫的抗性强于或候选强于G:G基因型的所述待测大豆;

所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位;所述SNP位点处的核苷酸为G或T;

所述T:T基因型为大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位为T的纯合型;

所述G:G基因型为大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位为G的纯合型。

8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于:所述“检测待测大豆的基因组中如下SNP位点处的核苷酸”的方法包括如下两个步骤:PCR扩增和对所述PCR扩增所得产物采用限制性内切酶AciI或其同裂酶进行完全酶切从而确定所述SNP位点处的核苷酸;所述PCR扩增所用的引物对满足如下条件:以所述待测大豆的基因组DNA为模板进行PCR扩增所得扩增产物的序列含有序列表中序列1。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于:所述引物对为权利要求3中所述的引物对A。

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