[发明专利]抗大豆胞囊线虫相关CAPS标记检测方法及引物

说明书

本发明公开了一种与大豆胞囊线虫抗性相关的CAPS标记检测方法及引物。本发明提供了大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定大豆对大豆胞囊线虫的抗性中的应用；所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为G或T。本发明通过检测所述SNP位点的基因型可选择出抗大豆胞囊线虫的材料，可避免耗时耗力的表型鉴定，通过基因型对育种材料进行大豆胞囊线虫抗性筛选，极大提高了育种过程中抗病品种的选择效率、缩短育种时间，对于抗大豆胞囊线虫品种的培育效果显著。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种与大豆胞囊线虫抗性相关的CAPS标记检测方法及引物。

背景技术

大豆胞囊线虫(Soybean Cyst Nematode，SCN)是一种根内必须性静态寄生线虫，对大豆生产造成了巨大的损失。仅在美国，从1996年到2014年，大豆上的各种病害中由大豆胞囊线虫造成的损害，约达到了36％。培育抗性材料及结合作物轮作是控制病害的一个主要方法。由于SCN抗性基因在遗传上的复杂性和大豆胞囊线虫生理小种的多样性，利用传统育种方法培育抗大豆胞囊线虫的品种不但需要花费很长的时间，而且难于成功，不能应对线虫的毒性变异，不能够满足当前抗线育种的发展，急需一种更为准确、高效的鉴定SCN的方法。随着分子标记的开发和使用，分子标记辅助选择(Molecular marker-assistedselection，MAS)成为可以节约人力、物力和加速育种进程的有效方法。MAS的最大优点是在不需要评估表型特征的情况下，通过确认是否带有目标基因而鉴定出抗性植株，能增加育种工作的效率和速度。

发明内容

本发明的第一个目的是提供大豆基因组(Glyma.Wm82.a2)中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定大豆胞囊线虫抗性中的应用。

所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为G或T。

本发明的第二个目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定大豆对大豆胞囊线虫的抗性的试剂。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定大豆对大豆胞囊线虫的抗性的试剂，是用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质；所述SNP位点在大豆基因组中对应于序列表中序列1所示核苷酸序列的第113位；所述SNP位点处的核苷酸为G或T。

具体的，所述“用于检测大豆基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”可为如下a)或b)：

a)引物对A，为如下(a1)或(a2)：

(a1)由序列表中序列2和序列3所示的两条单链DNA组成的引物对；

(a2)由将序列表中序列2和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对。

b)所述引物对A和限制性内切酶AciI或其同裂酶。

所述引物对A中，序列表中序列2所示的单链DNA和序列表中序列3所示的单链DNA的摩尔比可为1:1。所述引物对A中，两条单链DNA可独立包装，也可按照摩尔比1:1混合包装。

含有所述试剂的试剂盒也属于本发明的保护范围。

所述试剂或所述试剂盒在鉴定或辅助鉴定待测大豆对大豆胞囊线虫的抗性中的应用也属于本发明的保护范围。

本发明的第三个目的是提供如下两种鉴定大豆对大豆胞囊线虫的抗性的方法。