[发明专利]流式细胞仪测定染色体端粒长度的方法有效
申请号: | 201710751114.3 | 申请日: | 2017-08-28 |
公开(公告)号: | CN107488716B | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 周菊华 | 申请(专利权)人: | 沃森克里克(北京)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6816 | 分类号: | C12Q1/6816;G01N15/10;G01N21/64 |
代理公司: | 北京爱普纳杰专利代理事务所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 王玉松 |
地址: | 100094 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞 测定 染色体 端粒 长度 方法 | ||
本发明提供了一种流式细胞仪测定染色体端粒长度的快速方法,在常规的变性杂交步骤前增加一个避光冰浴的操作,让端粒探针有充足的时间进入细胞内部,并且在DNA变形后能快速、有效地与端粒DNA进行杂交,提高杂交的效率和成功率;采用1%的多聚甲醛作为固定液,固定效果更好、更加稳定,使用更加方便;在杂交缓冲液中添加70%去离子甲醛,可以在长时间进行探针杂交时保护细胞结构和DNA的稳定性,以提高杂交的成功率。通过上述改进,使本方法相对于传统测定染色体端粒长度的方法更加快速、精确,适用于长期、大规模的研究工作。
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,特别涉及一种流式细胞仪测定染色体端粒长度的方法。
背景技术
端粒是短的多重复的非转录序列(TTAGGG)及一些结合蛋白组成特殊结构,除了提供非转录DNA的缓冲物外,它还能保护染色体末端免于融合和退化,在染色体定位、复制、保护和控制细胞生长及寿命方面具有重要作用,并与细胞凋亡、细胞转化和永生化密切相关。当细胞分裂一次,每条染色体的端粒就会逐次变短一些。构成端粒的一部分基因约50~200个核苷酸,会因多次细胞分裂而不能达到完全复制(丢失),以至细胞终止其功能不再分裂。因此,严重缩短的端粒是细胞老化的信号。在某些需要无限复制循环的细胞中,端粒的长度在每次细胞分裂后,被能合成端粒的特殊性DNA聚合酶-端粒酶所保留。
染色体端粒长度与衰老密切相关,可以作为人体衰老的指标。目前常用的染色体端粒长度的测定方法,主要包括地高辛探针标记的DNA印迹法(Southern blot)、端粒限制性片段(TRF)印迹法和实时定量PCR法。这些方法均具有耗时长、操作繁琐、精确度低等缺陷,不适用于长期大规模的研究工作。
发明内容
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种流式细胞仪测定染色体端粒长度的方法。
本发明具体技术方案如下:
本发明提供了一种流式细胞仪测定染色体端粒长度的方法,包括如下步骤:
S1:细胞样品预处理:收集待测细胞的单细胞悬液,洗涤后进行冰浴固定,固定结束后将固定液洗脱,得到待测细胞样品;
S2:端粒杂交:向所述待测细胞样品中加入端粒杂交液,在避光条件下进行冰浴,取出后进行高温水浴变性,并在避光、室温条件下进行杂交,得到待测杂交样品;所述端粒杂交液为含有0.3mg/ml端粒探针的杂交缓冲液,所述端粒探针的碱基序列如下:
Tel-PNA:FITC-dipeptide-CCCTAACCCTAACCCTAA;
本方法在高温水浴变性之前加入一个避光、冰浴的操作,目的是让端粒探针有充足的时间进入细胞内部,并且在DNA变性后能快速、有效地与端粒DNA进行杂交,提高杂交的效率和成功率,同时通过避光避免端粒探针的荧光染料FITC发生降解;荧光染料与端粒分子无法直接连接,因此需要通过一个二肽分子作为连接分子进行连接,本方法中优选为两个赖氨酸(Lys)分子形成的二肽;
S3:洗涤备用:向所述待测杂交样品加入洗脱液进行洗脱,共洗脱三次,弃去洗脱液后加入FACS缓冲液进行悬浮,得到悬浮样品,低温保存备用;
S4:用流式细胞仪对所述悬浮样品进行分析,并计算染色体端粒的长度。
进一步地,所述步骤S1中,所述固定液为1%的多聚甲醛。
1%的多聚甲醛溶液作为固定液,相对于常用的Cytofix/Cytoperm试剂和4%的甲醛溶液来说,固定效果更好、性质更稳定,并且对细胞更加温和,使用更加方便。
进一步地,所述步骤S1中,所述洗脱使用的洗脱液为含有5%小牛血清和0.1%皂苷的磷酸缓冲液。
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