[发明专利]一种利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1有效

专利信息
申请号: 201710759409.5 申请日: 2017-08-30
公开(公告)号: CN107447012B 公开(公告)日: 2021-03-16
发明(设计)人: 杨旭;刘飞;张宇;成玉富 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 南京钟山专利代理有限公司 32252 代理人: 戴朝荣;郑慧娟
地址: 225009 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 利用 ssr 分子 标记 鉴定 栽培 野生 间杂 base sub
【权利要求书】:

1.一种利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤一:种间杂交F1杂种及其亲本的DNA提取;

步骤二:建立SSR反应体系及扩增反应程序:利用SSR标记引物emg01J09和emh21J12进行杂种鉴定,所述杂种为:迷你茄×赤茄、苏州牛角×赤茄、西安绿茄×旋花茄、迷你茄×红茄、迷你茄×旋花茄或苏州牛角×旋花茄的F1杂交后代,引物emg01J09-F具有SEQID NO.1的核苷酸序列;引物emg01J09-R具有SEQID NO.2的核苷酸序列;引物emh21J12-F具有SEQIDNO.3的核苷酸序列;引物emh21J12-R具有SEQID NO.4的核苷酸序列;

步骤三:聚丙烯酰胺凝胶电泳检测;

步骤四:杂交种真实性的鉴定;在杂交后代的扩增产物中,是否具有父母本互补型或父本型条带,若有则为真杂交种,反之,则为假杂交种。

2.如权利要求1所述的利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,步骤一中,以亲本和杂交种植株的叶片为材料,提取DNA;提取的DNA用1%的琼脂糖凝胶电泳进行纯度的检测。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述DNA样品置于-20℃保存。

4.如权利要求1所述的利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,步骤二中,所述SSR反应体系:6.7µl ddH2O,1.0µl 10×Buffer,0.2µl dNTPs,1.0µl 引物,0.1µl rTaq聚合酶、1.0µl DNA模板。

5.如权利要求1所述的利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,步骤二中,扩增反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性5min,55~60℃退火30s,72℃延伸45s,进行35个循环;最后72℃充分延伸10min,4℃保存。

6.如权利要求1所述的利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,步骤三中,电泳检测具体步骤为:扩增产物在6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,每个样品取1.4µl和0.7µl Loading Buffer混合点样,以DL500 DNA Maker为对照,在180V恒压下,电泳1.5h,随后进行银染观察。

7.如权利要求6所述的利用SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄种间杂交F1杂种的方法,其特征在于,银染具体步骤如下:

(1) 用自来水将电泳槽和四块玻璃板冲洗干净,放在操作台上自然蒸干;

(2) 按照长板外短板内的顺序,将玻璃板垂直安装到电泳槽上,拧紧;然后用1.0%琼脂胶封住底部,待用;

(3) 将模具倾斜45°,用摇晃均匀后的6%聚丙烯酰胺凝胶,缓缓倒入玻璃板的缝隙,至模具顶部为止;随后迅速插上梳子,仔细观察是否有气泡残留,确定好后,室温放置1~2h进行凝固;

(4) 凝固好后,放到加满1×TBE电泳缓冲液的电泳槽中,小心地拔出梳子,避免气泡产生,随后点样,然后进行电泳;

(5) 结束后,缓缓倒出缓冲液,取下胶板,从玻璃板中取出凝胶,先放入固定液中轻摇2~3min;在染色液中轻晃3~5min;再在蒸馏水中漂洗2~3次,每次时间不超过15s;随后放到显影液中轻轻摇晃,直至条带出现;最后观察后拍照分析。

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