[发明专利]一种生物分析平台中的项目实施质控系统在审
申请号: | 201710792133.0 | 申请日: | 2017-09-05 |
公开(公告)号: | CN107609349A | 公开(公告)日: | 2018-01-19 |
发明(设计)人: | 李山;庄振华;胡涛;李良波;王其;白丽军;杨斌 | 申请(专利权)人: | 成都生命基线科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06Q10/06;G06Q10/10 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙)51220 | 代理人: | 郭受刚 |
地址: | 610000 四川省成都市高新区天*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 生物 分析 平台 中的 项目 实施 系统 | ||
1.一种生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,所述系统包括:
分配单元,用于基于用户的生物信息分析项目信息自动分配相应的平台支持单元;
平台支持单元,用于基于数据库中预设的生物信息领域技术信息,对用户的生物信息分析项目信息进行分析,生成生物信息分析项目发布需求信息;
项目发布单元,用于基于生成的生物信息分析项目发布需求信息,发布相应的生物信息分析项目;
项目实施单元,用于工程师接受发布的生物信息分析项目,并将完成的信息上传;
评审单元,用于基于生物信息分析项目评审规则对工程师上传的信息进行评审,生成相应的评审信息,并将评审信息发送至相应的客户。
2.根据权利要求1所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,所述项目实施单元具体包括:
拆分单元,用于将生物信息分析项目拆分为多个阶段性生物信息分析子项目;
上传单元,用于工程师上传完成的阶段性生物信息分析子项目;
检测单元,用于对上传的阶段性生物信息分析子项目进行检测,并将检测结果反馈给相应的工程师。
3.根据权利要求1所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,所述系统还包括评分单元,用于用户基于工程师上传的生物信息分析项目质量对相应的工程师进行评分。
4.根据权利要求1所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,所述系统还包括分析内容选择单元,用于选择生物信息分析项目的标准化分析或个性化分析。
5.根据权利要求4所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,对Small RNA测序分析时,标准化分析内容为:a、数据过滤质控及统计;b、Small RNA长度分布统计;c、品间的公共序列和特异序列的分析;d、Small RNA在选定的参考基因组上的分布;e、Small RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息;f、Small RNA与重复序列的比对信息;
个性化分析内容包括:a、已知miRNA和novel miRNA的靶基因预测;b、已知miRNA和Novel miRNA靶基因GO注释和KEGG;c、已知miRNA的碱基编辑分析;d、已知miRNA差异分析和聚类分析;e、novel miRNA差异分析和聚类分析;f、差异miRNA靶基因预测;g、差异miRNA靶基因GO注释和KEGG通路分析。
6.根据权利要求1所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,所述项目实施单元还用于工程师基于生物信息分析项目,生成项目实施计划,并将项目实施计划发送给客户。
7.根据权利要求6所述的生物分析平台中的项目实施质控系统,其特征在于,Small RNA测序分析时,项目实施单元生成的的项目实施计划为:
A、建库测序,具体步骤包括:取样、样品检测、建库测序、上机测序、测序结果下机;
B、标准化分析,具体步骤包括:质控、比对、sRNA表达水平计算;
C、个性化分析,具体步骤包括:靶基因预测、差异分析、通路分析。
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