[发明专利]一种生物分析平台中的项目实施质控系统在审
申请号: | 201710792133.0 | 申请日: | 2017-09-05 |
公开(公告)号: | CN107609349A | 公开(公告)日: | 2018-01-19 |
发明(设计)人: | 李山;庄振华;胡涛;李良波;王其;白丽军;杨斌 | 申请(专利权)人: | 成都生命基线科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06Q10/06;G06Q10/10 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙)51220 | 代理人: | 郭受刚 |
地址: | 610000 四川省成都市高新区天*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 生物 分析 平台 中的 项目 实施 系统 | ||
技术领域
本发明涉及铁路接触网检测领域,具体地,涉及一种生物分析平台中的项目实施质控系统。
背景技术
生物信息分析项目是分析基因序列中表达的结构功能特征,需要根据科学研究目的,利用计算机对生物信息进行储存、检索和分析。整个项目涉及到生物学、计算机、数学等多个学科,如何对项目质量的实际情况进行准确度量、如何控制项目进度质量、如何反馈项目技术问题并采取纠偏措施显得非常重要。
传统的企业没有采用在线的互联网平台的模式来做多层次的质量控制,多是企业内部的工作流程,相对来说存在以下的问题:
1.仅供企业内部人员了解,客户不能实时查看信息,导致项目信息沟通的封闭和滞后;
2.不是作为第三方的质控平台,可能存在质控上的不严格;
3.很多企业没有专业人员进行质控,也没有在项目实施的每一个重要节点进行与客户的交互,征询意见。
发明内容
本发明提供了一种生物分析平台中的项目实施质控系统,解决了传统的生物信息分析项目质量无法有效控制的技术问题,实现了通过本系统能够有效对生物信息分析项目质量进行控制的技术效果。
为实现上述发明目的,本申请提供了一种生物分析平台中的项目实施质控系统,所述系统包括:
分配单元,用于基于用户的生物信息分析项目信息自动分配相应的平台支持单元;
平台支持单元,用于基于数据库中预设的生物信息领域技术信息,对用户的生物信息分析项目信息进行分析,生成生物信息分析项目发布需求信息;
项目发布单元,用于基于生成的生物信息分析项目发布需求信息,发布相应的生物信息分析项目;
项目实施单元,用于工程师接受发布的生物信息分析项目,并将完成的信息上传;
评审单元,用于基于生物信息分析项目评审规则对工程师上传的信息进行评审,生成相应的评审信息,并将评审信息发送至相应的客户。
进一步的,所述项目实施单元具体包括:
拆分单元,用于将生物信息分析项目拆分为多个阶段性生物信息分析子项目;
上传单元,用于工程师上传完成的阶段性生物信息分析子项目;
检测单元,用于对上传的阶段性生物信息分析子项目进行检测,并将检测结果反馈给相应的工程师。
其中,平台支持单元为通过大数据采集建立数据库,通过采集大量的生物信息分析技术员相关的专业信息,利用采集的信息建立相应的数据库,用于在系统运行时进行支持。
进一步的,所述系统还包括评分单元,用于用户基于工程师上传的生物信息分析项目质量对相应的工程师进行评分。
进一步的,所述系统还包括分析内容选择单元,用于选择生物信息分析项目的标准化分析或个性化分析。
进一步的,对Small RNA(小RNA)测序分析时,标准化分析内容为:a、数据过滤质控及统计;b、Small RNA长度分布统计;c、品间的公共序列和特异序列的分析;d、Small RNA在选定的参考基因组上的分布;e、Small RNA与rRNA(核糖体RNA)、tRNA(转运RNA)、snRNA(细胞内有小核RNA)、snoRNA(核仁小分子RNA)的比对信息;f、Small RNA与重复序列的比对信息;
个性化分析内容包括:a、已知miRNA(micro RNA,微小RNA)和novel miRNA(新的微小RNA)的靶基因预测;b、已知miRNA和Novel miRNA靶基因GO(Gene Onotology,基因本体)注释和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因与基因组百科全书);c、已知miRNA的碱基编辑分析;d、已知miRNA差异分析和聚类分析;e、novel miRNA差异分析和聚类分析;f、差异miRNA靶基因预测;g、差异miRNA靶基因GO注释和KEGG通路分析。
Small RNA:Small RNA是指在生物体中表达的,不编码蛋白,长度较短(18~30nt或40nt)的RNA分子,参与诱导基因沉默,参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。主要包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。家族成员众多。
miRNA:microRNA,简称miRNA,是目前功能研究较为透彻的一类小RNA(20~25nt)。miRNA通过与特定mRNA的结合调节相应基因的表达,这些基因称为该mRNA的靶基因。
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