[发明专利]检测SMAD4基因V354L位点突变的试剂盒有效
申请号: | 201710822778.4 | 申请日: | 2017-09-13 |
公开(公告)号: | CN107385097B | 公开(公告)日: | 2018-05-15 |
发明(设计)人: | 赵小刚;唐东起;王文娟;李培超 | 申请(专利权)人: | 山东大学第二医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 朱家富 |
地址: | 250033 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 smad4 基因 v354l 突变 试剂盒 | ||
本发明涉及检测SMAD4基因V354L位点突变的试剂盒,包括:检测SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的特异引物,所述特异性引物的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述特异引物的下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次揭示了SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变与接受辅助性化疗的非小细胞肺癌患者预后密切相关,并根据该发现设计出检测试剂盒,为非小细胞肺癌患者个体化的辅助性化疗提供指导。
技术领域
本发明涉及一种检测SMAD4基因V354L位点突变的试剂盒,属于生物技术和医学技术领域。
背景技术
SMAD4是一种抑癌基因,常见于胰腺癌和结肠癌。转化生长因子β(TGF-β)调节着细胞生长、分化以及多种生理、病理过程,TGF-β与SMAD4构成的信号通路与肿瘤的发生机制密切相关,SMAD4在该信号通路中发挥着核心作用。相关研究发现,SMAD4基因的缺失或突变与肿瘤细胞的侵袭、淋巴结转移以及肿瘤血管形成密切相关。SMAD4基因的缺失还可以促进肺癌的发生与发展,当SMAD4基因被敲除后,肺癌细胞对DNA拓扑异构酶抑制剂的敏感性增强。
Taqman探针是一种荧光检测技术,用含有特异序列的荧光标记探针来检测PCR产物,Taqman探针的出现使得定量PCR技术的特异性有了很大提高。该特异性的荧光探针在两条引物之间与模板特异性地结合。在探针的5’端标记有荧光报告基团如FAM、VIC等,在探针的3’端标记荧光淬灭基团。当探针完整时,仪器检测不到荧光信号,因为报告基团发射的荧光信号会会被淬灭基团吸收;在PCR扩增过程中,Taq DNA聚合酶会酶切降解与模板相结合的探针,导致3’端淬灭基团与5’端报告基团分离,仪器就可以检测到荧光信号。
目前发明一种能够快速检测患者SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的方法,进而有助于指导非小细胞肺癌患者辅助性化疗方案的选择,成为急需解决的问题。
发明内容
本发明针对现有技术在检测SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变时所表现出的缺点,提供一种准确、快速、廉价的检测SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的试剂盒。
发明概述
发明人采用二代高通量测序技术检测到SMAD4基因V354L(c.1060G>C)突变位点,并通过统计学方法分析发现了接受辅助性化疗的肺癌患者的预后与SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变密切相关。在所有检测到SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的IIB or IIIA期非小细胞肺癌患者中,接受卡铂联合多西他赛的辅助性化疗方案相比于卡铂联合长春瑞滨,患者的无病生存期(DFS)以及总生存期(OS)显著延长。然而在所有SMAD4基因该位点没有发生突变的IIB or IIIA期非小细胞肺癌患者中,卡铂联合多西他赛方案或者卡铂联合长春瑞滨方案,对患者预后的影响无统计学差异。根据上述发现,发明人根据实时荧光定量PCR检测方法,设计出一种检测SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的试剂盒,该试剂盒能够准确、快速地检测SMAD4基因该位点的突变,并且操作较为简便,成本相对廉价。
发明详述
检测SMAD4基因V354L位点突变的试剂盒,包括:
检测SMAD4基因V354L(c.1060G>C)位点突变的特异性引物,所述特异性引物的上游核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
根据本发明优选的,上述试剂盒,还包括:
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