[发明专利]一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针有效
申请号: | 201710829135.2 | 申请日: | 2017-09-14 |
公开(公告)号: | CN107400722B | 公开(公告)日: | 2020-02-07 |
发明(设计)人: | 林志铿;杨璐平;王松林 | 申请(专利权)人: | 厦门为正生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 35200 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) | 代理人: | 马应森 |
地址: | 361026 福建省厦门市海沧区新阳街道翁*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 基因组 竞争性 实时 荧光 pcrsnp 探针 | ||
1.一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于具有二级结构,包含与完全不互补序列且具备水解性的半环状结构以及完全互补序列的荧光探针;
所述具有二级结构,将含有SNP位点的碱基序列置于荧光探针5’端,并在荧光探针3’端附近外加与探针完全不匹配的3~7个碱基使其形成具备水解性的半环状结构,3’端与5’端添加完全互补的3~5个碱基。
2.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于在实时荧光PCR检测过程中,具有耐高温聚合酶外切酶活性且不产生非特异信号。
3.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针经修饰其5’端有报告基团,3’端有淬灭基团。
4.如权利要求3所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述报告基团包括ALEX-350、FAM、VIC、TET、CAL Fluor Gold 540、JOE、HEX、CAL FlourOrange 560、TAMRA、Cal Fluor Red 590、ROX、CAL Fluor 20Red 610、TEXAS RED、CALFlour Red 635、Quasar 670、CY3、CY5、CY5.5或Quasar 705。
5.如权利要求3所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述淬灭基团包括DABCYL、BHQ、ECLIPSE或TAMRA。
6.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述SNP位点的碱基序列位于荧光探针5’端,荧光探针3’端外加的3~5个碱基将与人体基因组模板共同竞争,与荧光探针5’端进行互补。
7.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针在3’端外加3~5个碱基,与探针的5’端互补;所述荧光探针在3’端外加3~5个碱基;所述碱基GC%为50%~70%。
8.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针的长度为25~35个碱基。
9.如权利要求8所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针的长度为31个碱基。
10.如权利要求1所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针3’端外加3~5个碱基与探针不互补。
11.如权利要求10所述一种检测人基因组的竞争性实时荧光PCR SNP探针,其特征在于所述荧光探针3’端外加4个碱基与探针不互补。
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