[发明专利]检测HER2基因突变的特异性引物、液相芯片试剂盒和方法有效
申请号: | 201710835050.5 | 申请日: | 2017-09-15 |
公开(公告)号: | CN109504769B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 邓天发;刘志明;吴诗扬;许嘉森 | 申请(专利权)人: | 益善生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12N15/11 |
代理公司: | 华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香 |
地址: | 510663 广东省广州市广州高新技术产业*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 her2 基因突变 特异性 引物 芯片 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测HER2基因突变的液相芯片试剂盒,其特征在于,包括有:
(A).根据HER2基因的各种突变类型及野生型所设计的延伸引物对,所述延伸引物由5’端tag序列和3’端针对目的基因突变位点所设计的特异性引物序列组成;
所述延伸引物对为:
针对2325-2336ins(YVMA776-779 ins)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.11组成的序列,
针对2326-2337ins(YVMA776-779ins)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.12组成的序列,
针对2327-2339ins(G776V,Cins)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.13组成的序列,
针对2340-2348ins(GSP 781-783ins)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.14组成的序列,
针对2331-2336ins(CG 778-779ins)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.15组成的序列,和
针对2326GT(G776C)位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.10组成的序列及由SEQ IDNO.7和SEQ ID NO.16组成的序列,和
针对2264TC(L755S)位点的由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.17组成的序列及由SEQ IDNO.9和SEQ ID NO.18组成的序列;
(B).具有不同anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的磁珠,anti-tag序列与磁珠连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.19~SEQ ID NO.27,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).扩增引物:是针对不同的突变位点所设计的具有特异性的正反向引物对,用于扩增出待检测的目标序列,包含所述延伸引物所能检测的相应突变位点。
2.根据权利要求1所述的检测HER2基因突变的液相芯片试剂盒,其特征在于,所述扩增引物为:针对2325-2336ins(YVMA776-779 ins)、2326-2337ins(YVMA776-779ins)、2327-2339ins(G776V,Cins)、2340-2348ins(GSP 781-783ins)、2331-2336ins(CG 778-779ins)、2326GT(G776C)位点的SEQ ID NO.28及SEQ ID NO.29和
针对2264TC(L755S)位点的SEQ ID NO.30及SEQ ID NO.31。
3.根据权利要求1-2任一项所述的检测HER2基因突变的液相芯片试剂盒,其特征在于,所述间隔臂序列为:5-10个T。
4.用于HER2基因突变检测的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物为:针对2325-2336ins(YVMA776-779 ins)位点的SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.11,针对2326-2337ins(YVMA776-779ins)位点的和SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.12,针对2327-2339ins(G776V,Cins)位点的SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.13,针对2340-2348ins(GSP 781-783ins)位点的SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.14,针对2331-2336ins(CG 778-779ins)位点的SEQ ID NO.10及SEQ ID NO.15,针对2326GT(G776C)位点的SEQ ID NO.10及由SEQ ID NO.16,和针对2264TC(L755S)SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18。
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