[发明专利]一株马乳酒样乳杆菌ZW3菌株及其分子检测方法有效

专利信息
申请号: 201710844931.3 申请日: 2017-09-19
公开(公告)号: CN107699514B 公开(公告)日: 2020-09-18
发明(设计)人: 王艳萍;邢竹青;耿伟涛;侯乾宇;段晓微;张阳 申请(专利权)人: 诺佰克(武汉)生物科技有限公司;天津科技大学
主分类号: C12N1/20 分类号: C12N1/20;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/225
代理公司: 天津佳盟知识产权代理有限公司 12002 代理人: 颜济奎
地址: 430000 湖北省*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 一株马乳酒样乳 杆菌 zw3 菌株 及其 分子 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种快速鉴定马乳酒样乳杆菌(Lactobacillus kefiranofaciens subsp.kefiranofaciens)ZW3的分子检测方法,ZW3菌株的保藏编号CGMCC No.2809,保藏日2008年12月18日,其特征是:在结合镜检观察形态学特征和16S rDNA的基础上运用MLST方法,设计特异性引物序列进行PCR,用于识别马乳酒样乳杆菌ZW3;包括以下步骤:

(1)形态学观察待测菌株;

(2)提取待测菌株的基因组DNA;

(3)对待测菌株进行16S rDNA比对;

(4)选取管家基因rpoA、Hsp60、LeuS、rpsB、glyK、pyrG和fusA作为目的基因,设计并合成7组特异性引物;检测方法中用到的管家基因的排列顺序为rpoA-Hsp60-LeuS-rpsB-glyK-pyrG-fusA;

(5)以步骤(2)中提取得到的基因组DNA为模版,用步骤(4)中设计好的特异性引物进行PCR扩增得到片段产物;

(6)将扩增产物用0.8%的琼脂糖凝胶电泳进行分析;

(7)将扩增成功的PCR产物进行2次平行实验,并进行核酸测序,测序引物与PCR引物相同;

(8)结合镜检和16S rDNA比对结果的基础,将所获得的测序结果与马乳酒样乳杆菌ZW3各基因的标准序列进行比对;通过比对结果对单个基因的SNP位点进行统计,根据SNP位点确定该菌株的序列型即ST型;由ST型判断所测菌株是否为马乳酒样乳杆菌ZW3。

2.根据权利要求1所述的分子检测方法,其特征是:16S rDNA所用引物对如SEQ IDNO.1-SEQ ID NO.2所示。

3.根据权利要求1所述的分子检测方法,其特征是:步骤(4)中设计的7组特异性引物中,每组特异性引物分别包括正向引物和反向引物,引物序列见序列表中SEQ ID NO.3-SEQID NO.16。

4.根据权利要求1所述的分子检测方法,其特征是:马乳酒样乳杆菌ZW3的ST型为ST-1,序列号如SEQ ID NO.17所示。

5.权利要求1所述的快速鉴定马乳酒样乳杆菌ZW3的分子检测方法的应用,其特征是:所述的分子检测方法用于含有马乳酒样乳杆菌ZW3的发酵食品、药物以及保健品中菌株的检测。

6.根据权利要求5所述的应用,其特征是:所述的发酵食品为发酵乳、发酵果蔬、发酵植物蛋白或发酵肉制品。

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