[发明专利]与甘油三酯水平相关的基因功能性遗传变异及相关应用

说明书

本发明提供了与甘油三酯水平相关的基因功能性遗传变异及相关应用；具体而言，本发明提供了检测来自待测个体的样品中以下蛋白氨基酸位点和/或其对应的基因位点的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平、血脂异常和/或冠心病发病风险的检测系统中的应用：ACACB基因rs2075260和/或PPARA基因rs1800234遗传变异分别造成ACACB蛋白第2141位氨基酸和/或PPARA蛋白第227位氨基酸编码改变。出现ACACBVal2141Ile(rs2075260为A，氨基酸变为Ile)变异的待测个体具有较高的甘油三酯水平和/或较高的血脂异常和/或冠心病发病风险。出现PPARAVal227Ala(rs1800234为C，氨基酸变为Ala)变异的待测个体具有较低的甘油三酯水平和/或较低的血脂异常发病风险。

技术领域

本发明是关于与甘油三酯水平相关的基因功能性遗传变异及相关应用，具体而言，本发明是关于检测来自待测个体的样品中ACACB的Val2141Ile和/或PPARAVal227Ala变异情况的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平、血脂异常和/或冠心病发病风险的检测系统中的应用，还涉及一种评估血脂水平、血脂异常和/或冠心病发病风险的检测系统。

背景技术

大量研究资料表明，血脂异常是冠心病、心肌梗死、心脏性猝死和缺血性脑卒中的独立危险因素。它通过加速全身动脉粥样硬化，对身体造成隐匿、逐渐、进行性、全身性和器质性的损害。研究显示，人群血胆固醇水平每升高1％，冠心病(CAD)发病增加2％～3％。我国血脂异常患者总数上升呈显著趋势，2007～2008年中国国家糖尿病和代谢紊乱研究结果提示，我国20岁以上人群胆固醇水平与2002年相比增加了23.9％，血脂异常已经成为我国居民的重要公共卫生问题。2011年度北京市卫生与人群健康状况报告数据显示，北京市常住居民中超半数市民血脂异常，其中18～30岁男性的血脂异常患病率已经达到58.5％。

血浆总胆固醇(TC)、甘油三酯(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和甘油三酯(TG)浓度是心血管疾病最重要的危险因素和治疗干预的靶点和目标。世界卫生组织最新资料提示心血管疾病防控获益中，血脂异常危险因素控制所带来的贡献最大。美国1980～2000年期间冠心病死亡下降一半，完全归功于开展国民胆固醇教育所作出的贡献。

大多数血脂异常具有复杂的病因机制，是多个基因之间或多个基因与环境因长期相互作用的结果。全基因组关联研究成功地确定了多个与血脂相关的遗传位点，然而，几乎所有这些位点最初都是在欧洲血统的人群中确定的，缺乏亚洲人群中的研究数据。此外，已知基因区域的功能位点往往是少见低频位点，具有重要的功能意义和临床意义，研究结果显示绝大多数功能少见变异(80％)存在着种族特异性。鉴于亚洲人群和欧洲人之间的环境暴露和遗传背景的差异巨大，因此亟需鉴定亚洲人群特别是中国人群中系统筛查血脂相关的功能变异和少见变异，将有助于对国人高脂血症预防、新药开发、诊断和个体化治疗。

发明内容

本发明的主要目的在于确定亚洲人群特别是东亚人群特异性的与血脂水平相关的基因功能性遗传变异，提供通过检测相关遗传位点评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的方法，并提供评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统及相关应用。

本案发明人以东亚人群包括中国人、菲律宾人、美籍华人、新加坡籍华裔、新加坡籍马来西亚人等为研究对象，分析研究了11万多个遗传变异与血脂水平的关联关系，确定了与甘油三酯(TG)水平相关的基因功能性遗传变异。所述的基因功能性遗传变异包括以下蛋白氨基酸位点和/或其对应的基因位点的变异：ACACB蛋白第2141位氨基酸和/或PPARA蛋白第227位氨基酸。其中，蛋白氨基酸位点对应的基因位点是指编码所述蛋白的基因的核苷酸序列中对应所述氨基酸位点的核苷酸位点。优选地，ACACB蛋白第2141位氨基酸对应的基因位点包括ACACB基因rs2075260；PPARA蛋白第227位氨基酸对应的基因位点包括PPARA基因rs1800234。